python使用hdf5storage创建mat文件
时间: 2023-12-29 17:06:21 浏览: 224
你可以使用hdf5storage模块来创建.mat文件,该模块提供了与MATLAB格式兼容的HDF5数据存储和读取功能。以下是一个简单的示例代码,可以将一个Numpy数组保存为.mat文件:
```python
import numpy as np
import hdf5storage
# 创建一个Numpy数组
data = np.array([[1, 2, 3], [4, 5, 6]])
# 将数组保存为MAT文件
hdf5storage.savemat('data.mat', {'data': data})
```
在这个示例中,我们将一个Numpy数组保存为名为"data.mat"的MAT文件。在MAT文件中,数据将作为名为"data"的变量存储。你可以使用MATLAB或任何能够读取MAT文件的程序加载这个文件,并访问其中的数据。
相关问题
python使用hdf5storage创建mat文件,不带压缩
如果你不希望对MAT文件进行压缩,可以在调用`hdf5storage.savemat()`函数时指定`compress`参数为False。以下是示例代码:
```python
import numpy as np
import hdf5storage
# 创建一个Numpy数组
data = np.array([[1, 2, 3], [4, 5, 6]])
# 将数组保存为MAT文件,不带压缩
hdf5storage.savemat('data.mat', {'data': data}, compress=False)
```
在这个示例中,`compress`参数被设置为False,意味着不进行压缩。这将使得MAT文件比压缩后的文件更大,但读取速度可能会更快。
用python的hdf5storage保存的mat文件,无法在c++用matio读取,原因是什么
可能是因为 Python 的 hdf5storage 库和 matio 读取 mat 文件的方式不同导致的。hdf5storage 库保存的 mat 文件也是基于 HDF5 文件格式的,但是不同于 MATLAB 中的 mat 文件,因此可能会导致 matio 无法正确读取。
如果需要在 C++ 中使用 matio 读取 hdf5storage 库保存的 mat 文件,可以考虑使用 HDF5 库来读取。HDF5 库可以读取 hdf5storage 库保存的 mat 文件,因为它们都基于 HDF5 文件格式。
以下是一个使用 HDF5 库读取 mat 文件的示例代码:
```c++
#include <iostream>
#include <string>
#include <vector>
#include "hdf5.h"
int main() {
// 打开 HDF5 文件
hid_t file_id = H5Fopen("data.mat", H5F_ACC_RDONLY, H5P_DEFAULT);
if (file_id < 0) {
std::cerr << "Failed to open HDF5 file." << std::endl;
return -1;
}
// 获取MATLAB变量的名称列表
std::vector<std::string> var_names;
H5G_info_t group_info;
herr_t status = H5Gget_info(file_id, &group_info);
if (status >= 0) {
var_names.resize(group_info.nlinks);
for (unsigned int i = 0; i < group_info.nlinks; i++) {
char var_name[1024] = {0};
H5Lget_name_by_idx(file_id, ".", H5_INDEX_NAME, H5_ITER_INC, i, var_name, sizeof(var_name), H5P_DEFAULT);
var_names[i] = var_name;
}
}
// 读取变量
for (const auto& var_name : var_names) {
hid_t dataset_id = H5Dopen2(file_id, var_name.c_str(), H5P_DEFAULT);
if (dataset_id < 0) {
std::cerr << "Failed to open dataset: " << var_name << std::endl;
continue;
}
// 获取数据类型
hid_t datatype_id = H5Dget_type(dataset_id);
if (datatype_id < 0) {
std::cerr << "Failed to get datatype for dataset: " << var_name << std::endl;
H5Dclose(dataset_id);
continue;
}
// 获取数据空间
hid_t dataspace_id = H5Dget_space(dataset_id);
if (dataspace_id < 0) {
std::cerr << "Failed to get dataspace for dataset: " << var_name << std::endl;
H5Tclose(datatype_id);
H5Dclose(dataset_id);
continue;
}
// 获取数据维度
int ndims = H5Sget_simple_extent_ndims(dataspace_id);
if (ndims < 0) {
std::cerr << "Failed to get number of dimensions for dataset: " << var_name << std::endl;
H5Sclose(dataspace_id);
H5Tclose(datatype_id);
H5Dclose(dataset_id);
continue;
}
std::vector<hsize_t> dims(ndims);
H5Sget_simple_extent_dims(dataspace_id, dims.data(), NULL);
// 创建内存空间存储数据
std::vector<double> data(dims[0] * dims[1]);
hid_t mem_dataspace_id = H5Screate_simple(2, dims.data(), NULL);
// 读取数据
status = H5Dread(dataset_id, H5T_NATIVE_DOUBLE, mem_dataspace_id, dataspace_id, H5P_DEFAULT, data.data());
if (status < 0) {
std::cerr << "Failed to read dataset: " << var_name << std::endl;
} else {
std::cout << "Variable: " << var_name << std::endl;
for (int i = 0; i < dims[0]; i++) {
for (int j = 0; j < dims[1]; j++) {
std::cout << data[i * dims[1] + j] << " ";
}
std::cout << std::endl;
}
}
// 关闭数据集和数据空间
H5Sclose(mem_dataspace_id);
H5Sclose(dataspace_id);
H5Tclose(datatype_id);
H5Dclose(dataset_id);
}
// 关闭 HDF5 文件
H5Fclose(file_id);
return 0;
}
```
注意,在使用 HDF5 库读取 mat 文件时需要先打开 HDF5 文件,然后获取 MATLAB 变量的名称列表,再逐个读取变量。具体的读取操作可以参考上述示例代码。
如果以上方法仍然无法解决问题,可以考虑查看具体的报错信息或者寻求 hdf5storage 和 matio 社区的支持。
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