linux编译安装tRNAscan-SE,如何启动
时间: 2024-03-22 15:39:05 浏览: 24
在Linux上编译安装tRNAscan-SE后,可以通过以下命令启动:
```
/path/to/tRNAscan-SE-2.0/tRNAscan-SE tRNA_file
```
其中,`/path/to/tRNAscan-SE-2.0`是tRNAscan-SE的安装路径,`tRNA_file`是待分析的fasta格式的核酸序列文件。
你也可以通过运行`tRNAscan-SE -h`来查看tRNAscan-SE的帮助文档,其中包含了更多的命令行选项和使用说明。
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linux编译安装tRNAscan-SE,如何使用
tRNAscan-SE是一款用于搜索和预测细胞中转移RNA(tRNA)的软件,它可以在Linux系统上进行编译安装。下面是使用tRNAscan-SE的步骤:
1. 下载tRNAscan-SE的源代码,解压缩。
2. 打开终端,进入tRNAscan-SE的目录。
3. 执行以下命令进行编译:
```
make
```
4. 执行以下命令进行安装:
```
make install
```
5. 安装完成后,可以在终端中输入以下命令使用tRNAscan-SE进行搜索和预测:
```
tRNAscan-SE [options] <seq_file>
```
其中,<seq_file>为待预测的序列文件,[options]为可选参数,可以通过输入以下命令查看详细的参数说明:
```
tRNAscan-SE --help
```
注意:在使用tRNAscan-SE进行预测之前,需要事先准备好待预测的序列文件,并将其保存在合适的目录下。
linux下编译安装opencv-python
在Linux下编译安装OpenCV-Python可以按照以下步骤进行:
1. 安装OpenCV的依赖项
在终端中输入以下命令以安装OpenCV的依赖项:
```
sudo apt-get update
sudo apt-get install build-essential cmake git libgtk2.0-dev pkg-config libavcodec-dev libavformat-dev libswscale-dev
```
2. 克隆OpenCV源代码
在终端中输入以下命令以从GitHub上克隆OpenCV源代码:
```
git clone https://github.com/opencv/opencv.git
```
3. 克隆OpenCV-contrib源代码
在终端中输入以下命令以从GitHub上克隆OpenCV-contrib源代码:
```
git clone https://github.com/opencv/opencv_contrib.git
```
4. 进入OpenCV目录并创建build目录
在终端中输入以下命令以进入OpenCV目录并创建build目录:
```
cd opencv
mkdir build
cd build
```
5. 配置OpenCV编译选项
在终端中输入以下命令以配置OpenCV编译选项:
```
cmake -D CMAKE_BUILD_TYPE=RELEASE -D CMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local -D OPENCV_EXTRA_MODULES_PATH=../../opencv_contrib/modules ..
```
6. 编译和安装OpenCV
在终端中输入以下命令以编译和安装OpenCV:
```
make -j4
sudo make install
```
7. 安装OpenCV-Python
在终端中输入以下命令以安装OpenCV-Python:
```
pip install opencv-python
```
现在,您已经成功地在Linux下编译安装了OpenCV-Python。