simpleaffy包
时间: 2023-10-22 17:28:23 浏览: 174
simpleaffy包是一个在使用BioConductor中的R语言进行分析时非常有用的包。它提供了处理CEL数据的程序,可以对CEL数据进行标准化并导入实验信息。在安装simpleaffy包之前,需要先执行以下代码:source("http://bioconductor.org/biocLite.R")和biocLite("simpleaffy")。安装成功后,可以使用library("simpleaffy")加载该包。在使用simpleaffy包之前,需要先整理好实验设计信息,即一个包含芯片名字和样本名字的文本文件。在R中使用simpleaffy包读取实验信息文本文件的示例代码如下:celfiles <- read.affy(covdesc="phenodata.txt", path="data")。这样就可以使用simpleaffy包进行后续的数据分析了。<span class="em">1</span><span class="em">2</span><span class="em">3</span>
#### 引用[.reference_title]
- *1* [install.packages("simpleaffy") 报错package ‘simpleaffy’ is not available (for R version 3.3.1)](https://blog.csdn.net/zhutouhexiaona/article/details/52775226)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_1"}}] [.reference_item style="max-width: 50%"]
- *2* *3* [keil551的芯片包不能用_r语言中使用Bioconductor 分析芯片数据](https://blog.csdn.net/weixin_39761696/article/details/110301199)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_1"}}] [.reference_item style="max-width: 50%"]
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