linux编译安装tRNAscan-SE,如何使用

时间: 2023-10-29 18:05:50 浏览: 58
tRNAscan-SE是一款用于搜索和预测细胞中转移RNA(tRNA)的软件,它可以在Linux系统上进行编译安装。下面是使用tRNAscan-SE的步骤: 1. 下载tRNAscan-SE的源代码,解压缩。 2. 打开终端,进入tRNAscan-SE的目录。 3. 执行以下命令进行编译: ``` make ``` 4. 执行以下命令进行安装: ``` make install ``` 5. 安装完成后,可以在终端中输入以下命令使用tRNAscan-SE进行搜索和预测: ``` tRNAscan-SE [options] <seq_file> ``` 其中,<seq_file>为待预测的序列文件,[options]为可选参数,可以通过输入以下命令查看详细的参数说明: ``` tRNAscan-SE --help ``` 注意:在使用tRNAscan-SE进行预测之前,需要事先准备好待预测的序列文件,并将其保存在合适的目录下。
相关问题

linux编译安装tRNAscan-SE,如何启动

在Linux上编译安装tRNAscan-SE后,可以通过以下命令启动: ``` /path/to/tRNAscan-SE-2.0/tRNAscan-SE tRNA_file ``` 其中,`/path/to/tRNAscan-SE-2.0`是tRNAscan-SE的安装路径,`tRNA_file`是待分析的fasta格式的核酸序列文件。 你也可以通过运行`tRNAscan-SE -h`来查看tRNAscan-SE的帮助文档,其中包含了更多的命令行选项和使用说明。

linux下编译安装opencv-python

在Linux下编译安装OpenCV-Python可以按照以下步骤进行: 1. 安装OpenCV的依赖项 在终端中输入以下命令以安装OpenCV的依赖项: ``` sudo apt-get update sudo apt-get install build-essential cmake git libgtk2.0-dev pkg-config libavcodec-dev libavformat-dev libswscale-dev ``` 2. 克隆OpenCV源代码 在终端中输入以下命令以从GitHub上克隆OpenCV源代码: ``` git clone https://github.com/opencv/opencv.git ``` 3. 克隆OpenCV-contrib源代码 在终端中输入以下命令以从GitHub上克隆OpenCV-contrib源代码: ``` git clone https://github.com/opencv/opencv_contrib.git ``` 4. 进入OpenCV目录并创建build目录 在终端中输入以下命令以进入OpenCV目录并创建build目录: ``` cd opencv mkdir build cd build ``` 5. 配置OpenCV编译选项 在终端中输入以下命令以配置OpenCV编译选项: ``` cmake -D CMAKE_BUILD_TYPE=RELEASE -D CMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local -D OPENCV_EXTRA_MODULES_PATH=../../opencv_contrib/modules .. ``` 6. 编译和安装OpenCV 在终端中输入以下命令以编译和安装OpenCV: ``` make -j4 sudo make install ``` 7. 安装OpenCV-Python 在终端中输入以下命令以安装OpenCV-Python: ``` pip install opencv-python ``` 现在,您已经成功地在Linux下编译安装了OpenCV-Python。

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