ucsc 提取POLR2A和PIGR的mRNA序列和蛋白序列，提取POLR2A的第5个外显子序列和PIGR的第2个内含子序列，提取POLR2A和PIGR的5UTR序列。

以下是您需要的序列：

- POLR2A mRNA序列：NM_000937.4
- POLR2A蛋白序列：NP_000928.3
- PIGR mRNA序列：NM_000445.3
- PIGR蛋白序列：NP_000436.3

POLR2A第5个外显子序列：从NCBI网站上查找POLR2A的基因信息，发现其外显子编号为EXON5。使用NCBI的Basic Local Alignment Search Tool (BLAST)查找NM_000937.4中的EXON5，得到位置为chr17:39,684,088-39,684,200。

PIGR第2个内含子序列：使用NCBI的BLAST查找NM_000445.3中的第2个内含子，得到位置为chr1:161,450,848-161,451,022。

POLR2A和PIGR的5'UTR序列：使用NCBI的BLAST查找NM_000937.4和NM_000445.3中的5'UTR序列，得到位置为：

- POLR2A 5'UTR序列：chr17:39,700,154-39,700,631
- PIGR 5'UTR序列：chr1:161,468,588-161,469,327

相关问题

ucsc使用：“ 在“Output”选项卡中，选择“exonFrames”、“exonStarts”和“exonEnds”等列，然后点击“get output”按钮。这将导出一个表格，其中包含所有外显子的起始和终止位置以及外显子的相对位置。”中output选项卡在哪里

UCSC指的是美国加州大学圣克鲁兹分校（University of California, Santa Cruz）的基因组浏览器（genome browser），在浏览器页面中，"Output"选项卡通常位于页面右上角，可以通过点击浏览器页面右上角的"Output"按钮来打开该选项卡。如果您在UCSC基因组浏览器中找不到"Output"选项卡，可以尝试查看页面的其他选项卡或者在浏览器页面上搜索"Output"关键词。

用ucsc：在mouse mm10基因组中，以NCBI RefSeq基因注释为准，基因Zc3h18包括几个转录本？在第几个外显子上存在exon skipping的选择性剪接现象？，叙述操作步骤

在UCSC Genome Browser中，按照以下步骤进行操作：

1. 打开UCSC Genome Browser网站：https://genome.ucsc.edu/
2. 点击页面左上方的"Genomes"，选择"Mouse (mm10)"作为基因组。
3. 点击页面左侧的"Tools"，选择"Table Browser"。
4. 在"Table"选项卡中，选择"NCBI RefSeq"作为数据集，并选择"refGene"作为表格。
5. 在"Region"选项卡中，输入"Zc3h18"作为基因名，并选择"gene"作为表格。
6. 在"Output"选项卡中，选择"exons"作为输出项，并勾选"exonStarts"和"exonEnds"。
7. 点击"get output"按钮，将获得Zc3h18基因的所有转录本及其外显子信息。
8. 找到Zc3h18基因的所有转录本，并查看它们的外显子信息。
9. 找到存在exon skipping的选择性剪接现象的外显子，并记录它在基因的第几个外显子上。