dbscan = DBSCAN(eps=0.001852*7, min_samples=2, algorithm='ball_tree', metric='haversine')
时间: 2023-12-06 17:03:10 浏览: 111
这段代码使用了DBSCAN聚类算法来对数据进行聚类,其中eps参数是DBSCAN算法中的一个关键参数,用于指定两个样本点之间的最大距离,超过这个距离则认为这两个样本点不属于同一簇。min_samples参数指定簇的最小数量,如果某个簇中的点数小于该值,则该簇会被视为噪声点。algorithm参数指定了使用的算法,这里选择的是ball_tree算法。metric参数指定了使用的距离度量,这里使用的是haversine距离,它是一种地理距离度量方法,适用于计算地球表面上两点之间的距离。
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coords = device_df.loc[:, ['loc_y', 'loc_x']].values kms_per_radian = 6371.0088 epsilon = 0.2 / kms_per_radian db = DBSCAN(eps=epsilon, min_samples=1, algorithm='ball_tree', metric='haversine') \ .fit(np.radians(coords))
这段代码针对 `device_df` DataFrame 进行了一些数据处理和使用 DBSCAN 算法进行聚类的操作。
首先,`coords` 被定义为 `device_df` 中的 `'loc_y'` 和 `'loc_x'` 列的值,并通过 `.loc[:, ['loc_y', 'loc_x']]` 进行选择。这将返回一个新的 DataFrame,其中只包含这两列的数据。然后,`.values` 方法被用于将这个 DataFrame 转换为一个 numpy.ndarray。
接下来,`kms_per_radian` 被赋值为 6371.0088,这是一个常数,用于将距离转换为弧度单位。
然后,`epsilon` 被定义为 0.2 除以 `kms_per_radian`。这是 DBSCAN 算法中定义空间可达性的参数。
接着,`db` 被初始化为一个 DBSCAN 对象,其中包括了一些参数设置:
- `eps` 设置为 `epsilon`,表示两个点之间的最大距离,超过这个距离则不属于同一个簇。
- `min_samples` 设置为 1,表示一个簇中至少要有多少个样本点。
- `algorithm` 设置为 'ball_tree',表示使用球树算法加速计算。
- `metric` 设置为 'haversine',表示使用哈弗斯因距离作为度量标准。
最后,通过调用 `.fit(np.radians(coords))` 方法,利用经纬度坐标的弧度化版本对 DBSCAN 算法进行训练和拟合。这将生成一个聚类模型,用于对定位点进行空间密度聚类。
import pandas as pd import numpy as np from sklearn.cluster import DBSCAN from sklearn import metrics from sklearn.cluster import KMeans import os def dbscan(input_file): ## 纬度在前,经度在后 [latitude, longitude] columns = ['lat', 'lon'] in_df = pd.read_csv(input_file, sep=',', header=None, names=columns) # represent GPS points as (lat, lon) coords = in_df.as_matrix(columns=['lat', 'lon']) # earth's radius in km kms_per_radian = 6371.0086 # define epsilon as 0.5 kilometers, converted to radians for use by haversine # This uses the 'haversine' formula to calculate the great-circle distance between two points # that is, the shortest distance over the earth's surface # http://www.movable-type.co.uk/scripts/latlong.html epsilon = 0.5 / kms_per_radian # radians() Convert angles from degrees to radians db = DBSCAN(eps=epsilon, min_samples=15, algorithm='ball_tree', metric='haversine').fit(np.radians(coords)) cluster_labels = db.labels_ # get the number of clusters (ignore noisy samples which are given the label -1) num_clusters = len(set(cluster_labels) - set([-1])) print('Clustered ' + str(len(in_df)) + ' points to ' + str(num_clusters) + ' clusters') # turn the clusters in to a pandas series # clusters = pd.Series([coords[cluster_labels == n] for n in range(num_clusters)]) # print(clusters) kmeans = KMeans(n_clusters=1, n_init=1, max_iter=20, random_state=20) for n in range(num_clusters): # print('Cluster ', n, ' all samples:') one_cluster = coords[cluster_labels == n] # print(one_cluster[:1]) # clist = one_cluster.tolist() # print(clist[0]) kk = kmeans.fit(one_cluster) print(kk.cluster_centers_) def main(): path = './datas' filelist = os.listdir(path) for f in filelist: datafile = os.path.join(path, f) print(datafile) dbscan(datafile) if __name__ == '__main__': main()
这是一个 Python 代码,主要使用了 Pandas、NumPy、sklearn.cluster 等库实现了 DBSCAN 和 KMeans 聚类算法。代码读入了一个文件夹中的多个文件,每个文件都是 GPS 坐标点的经纬度信息,然后使用 DBSCAN 算法进行聚类,并且输出了聚类的个数。接着使用 KMeans 算法对每个聚类进行细分,最后输出每个聚类的中心点坐标。
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