基于bayesian更新的em算法代码
时间: 2023-05-09 09:02:20 浏览: 127
EM算法代码
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EM算法是一种重要的统计学习算法,它广泛应用于概率模型的学习和参数估计,其中基于Bayesian更新的EM算法被认为是EM算法的进一步发展和改进。基本思想是,在每次迭代中,使用先前学习到的生成模型来更新参数,然后使用贝叶斯公式计算后验分布,并使用该后验分布来控制模型参数的更新,使模型收敛到局部最优解。
以下是基于Bayesian更新的EM算法的代码:
1.初始化模型参数
def initialize_parameters():
# initialize mean
mu = np.random.rand(k,d)
# initialize covariance matrix
cov = np.zeros((k,d,d))
for i in range(k):
cov[i] = np.eye(d)
# initialize mixture coefficients
pi = np.ones(k)/k
return mu, cov, pi
2. E步,根据当前参数计算每个样本属于混合高斯分布的后验概率
def E_step(X, mu, cov, pi):
# calculate the probability density function for all samples
g = np.zeros((len(X),k))
for c in range(k):
g[:,c] = multivariate_normal.pdf(X,mean=mu[c],cov=cov[c],allow_singular=True)
# calculate the posterior probability for all samples
posterior_prob = np.zeros((len(X),k))
for c in range(k):
posterior_prob[:,c] = pi[c]*g[:,c]
posterior_prob = posterior_prob / posterior_prob.sum(axis=1,keepdims=True)
return posterior_prob
3. M步,根据已知后验概率计算新的模型参数
def M_step(X, posterior_prob):
# update mixture coefficients
pi = posterior_prob.sum(axis=0) / len(X)
# update mean
mu = np.zeros((k,d))
for c in range(k):
for i in range(len(X)):
mu[c] += posterior_prob[i,c]*X[i]
mu[c] /= posterior_prob[:,c].sum()
# update covariance matrix
cov = np.zeros((k,d,d))
for c in range(k):
for i in range(len(X)):
xt = (X[i]-mu[c]).reshape((d,1))
cov[c] += posterior_prob[i,c]*np.dot(xt,xt.T)
cov[c] /= posterior_prob[:,c].sum()
return mu, cov, pi
4.执行EM算法
def EM(X, k, max_iter):
# initialize parameters
mu, cov, pi = initialize_parameters()
# run EM algorithm
for i in range(max_iter):
# E-step
posterior_prob = E_step(X, mu, cov, pi)
# M-step
mu, cov, pi = M_step(X, posterior_prob)
# calculate log-likelihood
ll = np.sum(np.log(np.sum(posterior_prob, axis=1)))
print('Iteration {}: log-likelihood = {}'.format(i+1, ll))
return mu, cov, pi
在这个代码中,首先是初始化模型参数,包括means、covariance matrices和mixing coefficients。然后,在E步骤中,计算每个样本属于每个高斯分布的后验概率。接着,在M步骤中,使用似然函数最大化法更新模型参数,即使用先前计算的后验概率来计算新的means、covariance matrices和mixing coefficients。最后,在每个迭代中,计算并打印对数似然函数值。最终,该函数返回最优的模型参数,即means、covariance matrices和mixing coefficients。
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