pbs作业脚本
时间: 2023-07-04 20:27:07 浏览: 266
PBS(Portable Batch System)是一种常用的高性能计算集群作业调度系统,允许用户提交和管理作业。下面是一个简单的PBS作业脚本示例:
```bash
#!/bin/bash
#PBS -N myjob # 作业名称
#PBS -o myjob.out # 输出文件名
#PBS -e myjob.err # 错误文件名
#PBS -l nodes=1:ppn=4 # 使用的节点数和每个节点的CPU核心数
#PBS -l walltime=1:00:00 # 作业最长运行时间
# 进入工作目录
cd $PBS_O_WORKDIR
# 执行作业
mpirun -np 4 ./myprogram
```
在这个脚本中,`#PBS`开头的行是PBS作业的属性设置,例如作业名称、输出文件名、使用的节点数和每个节点的CPU核心数、作业最长运行时间等。在脚本中,可以通过`$PBS_O_WORKDIR`环境变量获取作业提交的工作目录,执行作业的命令可以根据实际情况进行修改。
相关问题
如何编写pbs作业提交脚本
PBS(Portable Batch System)是一个常用的作业调度系统,可以用于大规模的集群计算。下面是一个简单的PBS作业提交脚本的示例:
```
#!/bin/bash
#PBS -N jobname
#PBS -l nodes=1:ppn=4
#PBS -l walltime=01:00:00
#PBS -o output.log
#PBS -e error.log
cd $PBS_O_WORKDIR
# 执行作业命令
./myjob
```
脚本中的每一行都有特定的作用,下面逐行解释:
- `#!/bin/bash`:指定解释器为bash;
- `#PBS -N jobname`:指定作业名为jobname;
- `#PBS -l nodes=1:ppn=4`:指定使用1个节点,每个节点使用4个处理器;
- `#PBS -l walltime=01:00:00`:指定作业最长运行时间为1小时;
- `#PBS -o output.log`:指定标准输出重定向到output.log文件;
- `#PBS -e error.log`:指定标准错误输出重定向到error.log文件;
- `cd $PBS_O_WORKDIR`:切换到作业提交时所在的目录;
- `./myjob`:执行作业命令,myjob为你要执行的程序名称。
在PBS集群中,你可以使用`qsub`命令提交作业,例如:
```
$ qsub jobscript.sh
```
其中,`jobscript.sh`为上面示例中的脚本文件名。
需要注意的是,PBS作业提交脚本的格式可能因不同的集群而有所不同,具体的格式和参数需要参考集群管理员提供的文档。
matlab的pbs作业提交脚本
下面是一个示例PBS作业提交脚本:
#PBS -N my_job
#PBS -l nodes=1:ppn=4
#PBS -l walltime=00:10:00
cd $PBS_O_WORKDIR
module load matlab
matlab -nodisplay -nosplash -r "my_matlab_script.m"
在这个脚本中,我们设置了作业名称为“my_job”,请求使用1个节点和4个处理器,以及10分钟的墙壁时间。然后,我们切换到PBS工作目录并加载MATLAB模块。最后,我们运行MATLAB脚本“my_matlab_script.m”,并指定不显示MATLAB GUI,也不显示任何闪烁信息。