如何使用DBSCAN算法对sklearn中的鸢尾花数据集进行聚类
时间: 2024-05-05 22:18:39 浏览: 142
可以使用以下代码进行聚类:
```
from sklearn.cluster import DBSCAN
from sklearn.datasets import load_iris
# 加载鸢尾花数据集
iris = load_iris()
X = iris.data
# 使用DBSCAN进行聚类,eps为邻域的距离阈值,min_samples为核心点的最小样本数
dbscan = DBSCAN(eps=0.5, min_samples=5).fit(X)
# 输出聚类结果
print(dbscan.labels_)
```
这样就可以对鸢尾花数据集进行聚类了。
相关问题
分别使用k-means、k medoids和DBSCAN算法对Sklearn中的鸢尾花数据集进行聚类(聚类数目设置为3),并评估这3种聚类算法的准确率。
首先,让我们了解这三种聚类算法:
1. **K-means**:这是一种基于距离的迭代算法,通过不断调整质心(中心点)使得每个样本点与其所属的簇中心的距离最小。它需要预先设定聚类的数量k。
2. **K-medoids (PAM)**:类似于K-means,但它选择的是每个簇内的代表样本(medoid),而非质心。这种方法对于离群值更鲁棒,因为它考虑了簇内所有样本。
3. **DBSCAN**:是一种密度聚类算法,不需要指定聚类数量。它将高密度区域视为一个簇,并能自动发现任意形状的簇和噪声点。
为了对sklearn的鸢尾花数据集进行聚类,我们可以按照以下步骤操作:
```python
from sklearn import datasets
from sklearn.cluster import KMeans, DBSCAN, MiniBatchKMeans, OPTICS
from sklearn.metrics import accuracy_score, confusion_matrix
# 加载数据
iris = datasets.load_iris()
X = iris.data
y = iris.target
# 使用K-means
kmeans = KMeans(n_clusters=3)
kmeans.fit(X)
y_pred_kmeans = kmeans.labels_
accuracy_kmeans = accuracy_score(y, y_pred_kmeans)
# 使用K-medoids
k_medoids = MiniBatchKMedoids(n_clusters=3)
k_medoids.fit(X)
y_pred_kmedoids = k_medoids.labels_
accuracy_kmedoids = accuracy_score(y, y_pred_kmedoids)
# 使用DBSCAN
dbSCAN = DBSCAN(eps=0.5, min_samples=10) # 调整超参数可能影响结果
dbSCAN.fit(X)
y_pred_dbscan = dbSCAN.labels_
accuracy_dbscan = accuracy_score(y, y_pred_dbscan)
# 由于DBSCAN无需预先指定聚类数,这里我们可能需要找到最佳的核心半径(epsilon)和邻域大小(min_samples)
# 可使用 elbow method 或 silhouette score 来确定合适的参数
confusion_matrices = {
'K-Means': confusion_matrix(y, y_pred_kmeans),
'K-Medoids': confusion_matrix(y, y_pred_kmedoids),
'DBSCAN': confusion_matrix(y, y_pred_dbscan)
}
print(f"Accuracy for K-Means: {accuracy_kmeans}")
print(f"Accuracy for K-Medoids: {accuracy_kmedoids}")
print(f"Accuracy for DBSCAN: {accuracy_dbscan}")
#
使用DBSCNA算法对sklearn中的鸢尾花数据集进行聚类代码(聚类数目设置为3)
以下是使用DBSCAN算法对sklearn中的鸢尾花数据集进行聚类的Python代码,聚类数目设置为3:
```python
from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.cluster import DBSCAN
import numpy as np
iris = load_iris()
X = iris.data
dbscan = DBSCAN(eps=0.5, min_samples=5)
dbscan.fit(X)
labels = dbscan.labels_
n_clusters_ = len(set(labels)) - (1 if -1 in labels else 0)
print('Estimated number of clusters: %d' % n_clusters_)
unique_labels = set(labels)
colors = [plt.cm.Spectral(each)
for each in np.linspace(0, 1, len(unique_labels))]
for k, col in zip(unique_labels, colors):
if k == -1:
# 黑色为噪声点
col = [0, 0, 0, 1]
class_member_mask = (labels == k)
xy = X[class_member_mask & core_samples_mask]
plt.plot(xy[:, 0], xy[:, 1], 'o', markerfacecolor=tuple(col),
markeredgecolor='k', markersize=14)
xy = X[class_member_mask & ~core_samples_mask]
plt.plot(xy[:, 0], xy[:, 1], 'o', markerfacecolor=tuple(col),
markeredgecolor='k', markersize=6)
plt.title('Estimated number of clusters: %d' % n_clusters_)
plt.show()
```
这里使用了DBSCAN算法,并设置eps为0.5,min_samples为5,聚类数目被自动估计。然后,我们在图表中画出每个聚类。如果有噪声点,则用黑色表示。
阅读全文