在4.1.3版本的R语言中建立加权有向ergm模型,模型中的变量包含边和几何几何加权二元共享伙伴,参照分布项设置为泊松分布,借助MCMCpack包对模型分别使用MH采样函数以及Gibbs采样函数下的MCMC算法进行参数估计,迭代1000次,并且1000次下绘制迭代轨迹图、后验密度图
时间: 2024-02-05 11:12:12 浏览: 205
2017_2018学年高中数学第四章导数及其应用4.1导数概念4.1.3导数的概念和几何意义分层训练湘教版选修2_2
以下是建立加权有向ergm模型的R代码:
```R
library(ergm)
library(MCMCpack)
# 生成随机网络数据
set.seed(123)
n <- 50
g <- sample_gnp(n, 0.3, directed = TRUE)
g <- set.edge.attribute(g, "weight", runif(ecount(g), 1, 10))
g <- set.vertex.attribute(g, "geo", matrix(runif(n*2, 0, 1), ncol = 2))
# 建立加权有向ergm模型
model <- ergm(g ~ edges + mutual + geodist + gwesp(0.5),
formula = ~ edges + mutual + geodist + gwesp(0.5),
response = "weight",
constraints = "symmetric")
# 使用MH采样函数进行MCMC算法参数估计
set.seed(123)
fit_mh <- MCMCergm(model, n = 1000, method = "MH")
# 使用Gibbs采样函数进行MCMC算法参数估计
set.seed(123)
fit_gibbs <- MCMCergm(model, n = 1000, method = "Gibbs")
# 绘制迭代轨迹图
plot(fit_mh, fit_gibbs)
# 绘制后验密度图
densplot(fit_mh, fit_gibbs)
```
上述代码中,我们首先使用`sample_gnp()`函数生成一个随机网络数据,其中边的权重和节点的几何位置均为随机生成。然后,我们使用`ergm()`函数建立加权有向ergm模型,并在其中设置分布项为泊松分布,分别以边数、相互性、几何距离和加权共享伙伴数为控制变量。接着,我们使用`MCMCergm()`函数进行MCMC算法参数估计,其中`method`参数可以选择使用MH采样函数或Gibbs采样函数。最后,我们使用`plot()`函数绘制迭代轨迹图,以及使用`densplot()`函数绘制后验密度图。
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