如何查看fastq文件
时间: 2023-12-21 14:04:09 浏览: 90
MutScan, 直接扫描FastQ文件检测和可视化目标突变.zip
要查看fastq文件,可以使用文本编辑器或者命令行工具。
1. 使用文本编辑器:打开fastq文件,可以看到四行数据,分别是序列标识符、序列、序列质量标识符、序列质量,如下所示:
```
@SEQ_ID
GATTTGGGGTTCAAAGCAGTATCGATCAAATAGTAAATCCATTTGTTCAACTCACAGTTT
+
!''*((((***+))%%%++)(%%%%).1***-+*''))**55CCF>>>>>>CCCCCCC65
```
2. 使用命令行工具:可以使用以下命令查看fastq文件的内容:
```
$ head file.fastq
$ less file.fastq
```
第一个命令会显示fastq文件的前几行,第二个命令则可以使用箭头键或者PageUp/PageDown翻页查看整个文件。
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