数字图像处理医学影像分析代码
时间: 2023-06-22 16:41:11 浏览: 164
数字图像处理代码
下面是一个基于Python和OpenCV的医学影像分析代码,可以实现医学影像的分割、特征提取和分类等功能:
```python
import cv2
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.cluster import KMeans
# 读取医学影像数据
img = cv2.imread('medical_image.jpg', 0)
# 影像预处理
blur = cv2.GaussianBlur(img, (5, 5), 0)
ret, thresh = cv2.threshold(blur, 0, 255, cv2.THRESH_BINARY + cv2.THRESH_OTSU)
# 影像分割
contours, hierarchy = cv2.findContours(thresh, cv2.RETR_TREE, cv2.CHAIN_APPROX_SIMPLE)
mask = np.zeros(img.shape, np.uint8)
for i in range(len(contours)):
if hierarchy[0][i][3] == -1:
cv2.drawContours(mask, contours, i, 255, -1)
# 影像特征提取
n_clusters = 3
X = img[np.where(mask == 255)]
X = np.reshape(X, (-1, 1))
kmeans = KMeans(n_clusters=n_clusters, random_state=0).fit(X)
centers = kmeans.cluster_centers_
labels = kmeans.labels_
for i in range(n_clusters):
mask[np.where((mask == 255) & (labels == i))] = centers[i]
# 影像分类
output = np.zeros(img.shape, np.uint8)
output[np.where(mask == 255)] = 255
# 显示结果
plt.subplot(221), plt.imshow(img, cmap='gray')
plt.title('Original Image'), plt.xticks([]), plt.yticks([])
plt.subplot(222), plt.imshow(thresh, cmap='gray')
plt.title('Thresholded Image'), plt.xticks([]), plt.yticks([])
plt.subplot(223), plt.imshow(mask, cmap='gray')
plt.title('Segmented Image'), plt.xticks([]), plt.yticks([])
plt.subplot(224), plt.imshow(output, cmap='gray')
plt.title('Classified Image'), plt.xticks([]), plt.yticks([])
plt.show()
```
说明:
1. 通过cv2.imread()函数读取医学影像数据,其中参数0表示读取为灰度图像。
2. 采用高斯滤波和Otsu自适应阈值法进行影像预处理,得到二值化图像。
3. 采用cv2.findContours()函数对影像进行分割,得到影像的轮廓。
4. 根据轮廓的层级关系,将轮廓进行分组,得到影像的主要部分。
5. 采用K-means聚类算法对影像进行特征提取,得到影像的主要颜色。
6. 将影像的主要颜色作为分类标准,将影像进行分类。
7. 通过matplotlib库将原始影像、二值化图像、分割后的影像和分类后的影像进行显示。
这个例子只是一个简单的医学影像处理代码,实际上医学影像处理涉及到的技术和算法非常多,需要根据具体问题进行选择和应用。
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