pymol linux 脚本保存
时间: 2023-09-22 08:01:46 浏览: 70
要在Pymol中保存Linux脚本,首先需要将脚本编写为一个文本文件。可以使用任何文本编辑器(例如gedit、nano或vi)来创建并编辑该文件,确保将其保存为以".py"为后缀的Python脚本文件。
在脚本中,可以使用Pymol的Python API来指定所需的操作和参数。例如,可以导入Pymol模块、打开一个分子文件、应用显示选项、设置渲染样式等等。脚本的功能和内容完全由用户自行决定。
编写完脚本后,可以通过命令行运行Pymol并指定脚本文件的路径。假设脚本名为"script.py",可以在终端中输入以下命令来运行脚本:
```
pymol -c script.py
```
这将在无窗口模式下运行Pymol,并执行脚本中定义的操作。
要将Pymol输出保存为文件,可以在脚本中使用Pymol的保存命令来指定输出文件的路径和格式。例如,使用以下命令将Pymol场景保存为图像文件:
```
cmd.png("output.png", width=800, height=600, dpi=300)
```
这将生成一个名为"output.png"的图像文件,宽度为800像素、高度为600像素,分辨率为300 dpi。
最后,可以使用Linux的文件管理器或命令行来访问和移动所保存的Pymol脚本和输出文件。可以通过直接在终端中输入文件路径来打开和编辑脚本文件,或者使用命令复制、移动或重命名文件。
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linuxshell脚本保存文件
在Linux Shell中,我们可以通过编写脚本来完成一些重复性的任务。当我们编写好脚本后,需要将其保存到一个文件中。以下是保存Shell脚本的步骤:
1. 打开一个文本编辑器,比如vi、nano等。
2. 在文本编辑器中输入Shell脚本代码。
3. 保存脚本文件,使用".sh"作为文件扩展名。例如,如果你想将脚本命名为"myscript.sh",则在保存时应输入以下命令:
```
:wq myscript.sh
```
其中,":wq"表示保存并退出编辑器。
4. 将脚本文件设置为可执行权限。在终端中运行以下命令:
```
chmod +x myscript.sh
```
5. 运行脚本文件。在终端中运行以下命令:
```
./myscript.sh
```
这样就可以执行你编写的Shell脚本了。
linux shell脚本保存退出
在 Linux 的 shell 中,若要保存并退出脚本,可以使用快捷键 `Ctrl + X` 和 `Ctrl + S` 来保存。也可以使用命令 `nano filename.sh` 来编辑并保存脚本。
如果你想让脚本执行并退出,可以使用命令 `sh filename.sh` 或 `bash filename.sh` 来执行脚本。