python 聚类分析时,选取三个特征变量建立聚类模型,给出具体步骤和代码,其中要包括标准化和PCA降维。在PCA降维之前需要看变量之间的相关性吗?为什么?给出具体代码
时间: 2024-02-22 16:58:14 浏览: 121
聚类分析是一种常用的无监督学习方法,可以对数据进行分组,对于选取特征进行聚类分析时,我们可以使用标准化和PCA降维来提高聚类效果。
以下是选取三个特征变量进行聚类分析的具体步骤和代码:
1. 导入所需库和数据集
```python
import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.cluster import KMeans
from sklearn.decomposition import PCA
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
# 导入数据集
data = pd.read_csv('data.csv')
# 选取三个特征变量
X = data[['feature1', 'feature2', 'feature3']]
```
2. 数据标准化
```python
# 对数据进行标准化
scaler = StandardScaler()
X_scaled = scaler.fit_transform(X)
```
3. 确定聚类数
```python
# 使用肘部法则确定聚类数
wcss = []
for i in range(1, 11):
kmeans = KMeans(n_clusters=i, init='k-means++', random_state=42)
kmeans.fit(X_scaled)
wcss.append(kmeans.inertia_)
plt.plot(range(1, 11), wcss)
plt.title('Elbow Method')
plt.xlabel('Number of clusters')
plt.ylabel('WCSS')
plt.show()
```
4. 聚类分析
```python
# 根据肘部法则确定聚类数
kmeans = KMeans(n_clusters=3, init='k-means++', random_state=42)
kmeans.fit(X_scaled)
y_kmeans = kmeans.predict(X_scaled)
```
5. PCA降维
```python
# 对数据进行PCA降维
pca = PCA(n_components=2)
X_pca = pca.fit_transform(X_scaled)
```
在PCA降维之前我们需要确定变量之间的相关性,因为PCA是基于变量之间的相关性进行降维的,如果变量之间没有相关性,那么使用PCA降维反而会丢失信息。我们可以使用以下代码来查看变量之间的相关性:
```python
corr = X.corr()
print(corr)
```
如果发现变量之间存在很强的相关性,可以考虑从中选择一个或几个变量进行分析。
完整代码如下:
```python
import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.cluster import KMeans
from sklearn.decomposition import PCA
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
# 导入数据集
data = pd.read_csv('data.csv')
# 选取三个特征变量
X = data[['feature1', 'feature2', 'feature3']]
# 对数据进行标准化
scaler = StandardScaler()
X_scaled = scaler.fit_transform(X)
# 使用肘部法则确定聚类数
wcss = []
for i in range(1, 11):
kmeans = KMeans(n_clusters=i, init='k-means++', random_state=42)
kmeans.fit(X_scaled)
wcss.append(kmeans.inertia_)
plt.plot(range(1, 11), wcss)
plt.title('Elbow Method')
plt.xlabel('Number of clusters')
plt.ylabel('WCSS')
plt.show()
# 根据肘部法则确定聚类数
kmeans = KMeans(n_clusters=3, init='k-means++', random_state=42)
kmeans.fit(X_scaled)
y_kmeans = kmeans.predict(X_scaled)
# 对数据进行PCA降维
pca = PCA(n_components=2)
X_pca = pca.fit_transform(X_scaled)
# 画出聚类图
plt.scatter(X_pca[:, 0], X_pca[:, 1], c=y_kmeans, cmap='viridis')
plt.title('Clustered Data')
plt.xlabel('PCA 1')
plt.ylabel('PCA 2')
plt.show()
```
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