基于C++定义一个学生类，实现上课过程的模拟和平时成绩的计算，应用STL库的相关容器对数据进行存储，程序数据可以保存到文件中，开始程序时自动读取。

好的，这是一个比较具体的编程问题，我会尽力回答。

首先，我们可以定义一个名为`Student`的类，它包含以下成员变量：

class Student {
public:
    string name; // 学生姓名
    int id; // 学生学号
    vector<double> scores; // 学生成绩
};

其中`scores`是用来存储学生每次考试的成绩的容器，这里我们使用了`vector`。

接下来，我们可以定义一个名为`Course`的类，它包含以下成员变量：

class Course {
public:
    string name; // 课程名称
    vector<Student> students; // 选修该课程的学生
};

其中`students`是用来存储选修该课程的学生的容器，这里我们使用了`vector`。

现在我们可以模拟上课过程，假设有一个名为`course`的`Course`对象，我们可以使用以下代码来添加学生：

Student s;
s.name = "张三";
s.id = 1001;
course.students.push_back(s);

然后，在每次考试结束后，我们可以使用以下代码来为每个学生添加成绩：

for (auto& s : course.students) {
    double score;
    cout << "请输入" << s.name << "的成绩：";
    cin >> score;
    s.scores.push_back(score);
}

接下来，我们可以使用STL库中的算法来计算每个学生的平时成绩，如下所示：

double calculate_average(const vector<double>& v) {
    double sum = accumulate(v.begin(), v.end(), 0.0);
    return sum / v.size();
}

for (auto& s : course.students) {
    double avg_score = calculate_average(s.scores);
    cout << s.name << "的平时成绩为：" << avg_score << endl;
}

最后，我们可以使用文件来保存程序数据。例如，我们可以使用以下代码将`course`对象保存到文件中：

ofstream file("data.txt");
file << course.name << endl;
for (const auto& s : course.students) {
    file << s.name << " " << s.id << " ";
    for (const auto& score : s.scores) {
        file << score << " ";
    }
    file << endl;
}
file.close();

在程序开始时，我们可以使用以下代码从文件中读取数据：

ifstream file("data.txt");
Course course;
file >> course.name;
while (file) {
    Student s;
    file >> s.name >> s.id;
    double score;
    while (file >> score) {
        s.scores.push_back(score);
    }
    course.students.push_back(s);
}
file.close();

以上就是一个简单的实现，当然还有许多细节需要考虑，例如异常处理、输入验证等。