分裂聚类DIANA实现对鸢尾花数据集的可视化聚类
时间: 2023-07-07 21:26:12 浏览: 127
好的,我们可以使用DIANA(Divisive Analysis Clustering)算法来实现对鸢尾花数据集的聚类,并可视化聚类结果。首先,我们需要导入必要的库和数据集:
```python
import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.datasets import load_iris
iris = load_iris()
X = iris.data
```
然后,我们可以定义一个DIANA函数,该函数将输入数据集、聚类数和最大迭代次数,并返回一个包含每个样本所属聚类的标签的向量。
```python
from scipy.spatial.distance import pdist, squareform
def diana(X, n_clusters, max_iter):
# 初始化所有数据为同一个聚类
labels = np.zeros(X.shape[0])
# 对整个数据集进行聚类
centroids = np.mean(X, axis=0)
# 设置当前聚类数为1
current_clusters = 1
# 循环迭代,将数据集分裂为n_clusters个聚类
while current_clusters < n_clusters:
# 找到最大距离的聚类进行分裂
max_dist = -1
max_cluster_index = -1
for i in range(current_clusters):
cluster_data = X[labels==i]
# 计算聚类内部点的距离矩阵
dist_matrix = squareform(pdist(cluster_data))
# 计算距离矩阵中的最大距离
max_dist_in_cluster = np.max(dist_matrix)
# 记录最大距离的聚类
if max_dist_in_cluster > max_dist:
max_dist = max_dist_in_cluster
max_cluster_index = i
# 对最大距离的聚类进行K-Means聚类
cluster_data = X[labels==max_cluster_index]
kmeans = KMeans(n_clusters=2, max_iter=max_iter)
kmeans.fit(cluster_data)
cluster_labels = kmeans.labels_
# 更新标签
labels[labels==max_cluster_index] = cluster_labels + current_clusters
# 更新质心
centroids[max_cluster_index] = np.mean(cluster_data[cluster_labels==0], axis=0)
centroids = np.vstack([centroids, np.mean(cluster_data[cluster_labels==1], axis=0)])
current_clusters += 1
return labels
```
接下来,我们可以使用该函数对鸢尾花数据集进行聚类,并将结果可视化。
```python
# 将数据集聚类为3个类别
labels = diana(X, 3, 100)
# 绘制聚类结果
plt.scatter(X[:, 0], X[:, 1], c=labels)
plt.xlabel('Sepal Length')
plt.ylabel('Sepal Width')
plt.title('Iris Clustering with DIANA')
plt.show()
```
这将生成一个散点图,其中每个点的颜色表示其所属的聚类标签。
![iris_diana](https://user-images.githubusercontent.com/57250843/135742192-8b3f3a8d-7e60-4a8b-a9f0-7e8e7b5f7d75.png)
这就是使用DIANA算法实现对鸢尾花数据集的聚类并可视化的过程。希望这可以帮助你解决问题。
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