我的文件较大，如何用高效的方法用python脚本将基因注释文件txt导入sql，表头包括GENE_ID、GO、IPR、KEGG、Swissprot、NR

您可以使用Python的pandas和sqlalchemy库来实现将基因注释文件txt导入sql的操作。具体步骤如下：

1. 导入所需的库：

import pandas as pd
from sqlalchemy import create_engine

2. 读取txt文件并转换为DataFrame：

df = pd.read_csv('gene_annotation.txt', sep='\t')

3. 创建数据库连接：

engine = create_engine('mysql+pymysql://username:password@localhost:3306/database_name')

其中，username为数据库用户名，password为密码，localhost为数据库所在的主机地址，3306为数据库端口号，database_name为数据库名称。

4. 将DataFrame写入数据库：

df.to_sql(name='gene_annotation', con=engine, if_exists='replace', index=False)

其中，name为表名，con为数据库连接对象，if_exists为写入数据时的操作方式，index为是否将DataFrame的索引写入数据库。

通过以上步骤，您就可以将基因注释文件txt导入sql，并创建一个名为gene_annotation的表，包含GENE_ID、GO、IPR、KEGG、Swissprot、NR这6个字段。