能看出来输出结果的含义吗

从Blastn命令行中的参数设置可以看出，输出结果的格式为表格格式，包括以下各列的信息：

1. qseqid：查询序列的ID。
2. qlen：查询序列的长度。
3. saccver：最佳匹配的参考序列的ID。
4. salltitles：最佳匹配的参考序列的标题。
5. slen：最佳匹配的参考序列的长度。
6. pident：匹配的百分比。
7. length：匹配的长度。
8. qcovs：查询序列覆盖参考序列的百分比。
9. bitscore：比特分数。
10. evalue：期望值。
11. staxids：最佳匹配的参考序列的分类学信息。

因此，输出结果是每个查询序列与参考数据库中的序列进行比对的结果，包括比对的相似性、长度、覆盖度等信息，可以用于进行序列注释、同源性分析等领域的研究。如果使用awk命令去除重复行后，输出文件中只保留了每个查询序列最好的匹配结果。

相关问题

能看出来输出结果包含了什么信息吗，每一列是什么内容

可以看出输出结果包含了以下信息：

- 查询序列的ID（qtitle）
- 查询序列的长度（qlen）
- 匹配的参考序列的ID（sseqid）
- 匹配度（pident）
- 匹配长度（length）
- 查询序列起始位置（qstart）
- 查询序列终止位置（qend）
- E值（evalue）
- 比特分数（bitscore）
- 参考序列的分类ID（staxids）
- 参考序列的标题（stitle）
- 参考序列的所有标题（salltitles）
- 参考序列的分类信息（sscinames）

每一列的具体含义如下：

1. qtitle: 查询序列的ID，即输入文件中每条序列的ID。
2. qlen: 查询序列的长度，即输入文件中每条序列的长度。
3. sseqid: 匹配的参考序列的ID，即参考数据库中每个序列的ID。
4. pident: 匹配度，即比对结果中两个序列的相似度。
5. length: 匹配长度，即比对结果中两个序列匹配上的长度。
6. qstart: 查询序列在比对结果中匹配的起始位置。
7. qend: 查询序列在比对结果中匹配的终止位置。
8. evalue: E值，即比对结果中两个序列匹配的期望值。
9. bitscore: 比特分数，即比对结果中两个序列的相似度得分。
10. staxids: 参考序列的分类ID，即参考数据库中每个序列所属的分类ID。
11. stitle: 参考序列的标题，即参考数据库中每个序列的标题信息。
12. salltitles: 参考序列的所有标题，即参考数据库中每个序列的所有标题信息。
13. sscinames: 参考序列的分类信息，即参考数据库中每个序列所属的分类信息。

上面命令输出的结果含义

上述命令的输出结果为：

Tracking computer: <ComputerName>
Sample 1, on <Date> at <Time>
Offset: <OffsetValue>ms
Sample 2, on <Date> at <Time>
Offset: <OffsetValue>ms

其中，`<ComputerName>` 为指定的计算机名称，如果未指定则为本地计算机名称。`<Date>` 和 `<Time>` 分别表示采样时间的日期和时间。`<OffsetValue>` 表示当前计算机与指定时间服务器之间的时间偏移量，单位为毫秒（ms）。如果 `<OffsetValue>` 为正数，则表示当前计算机的时间比指定时间服务器快；如果 `<OffsetValue>` 为负数，则表示当前计算机的时间比指定时间服务器慢。