在Java中如何使用JChem
时间: 2023-07-09 07:06:12 浏览: 78
JChem是一个Java化学计算和化学信息管理工具包,它包括了用于化学计算、化学信息管理和化学可视化的库。使用JChem,你可以执行诸如分子结构搜索、相似性搜索、反应预测、化合物库管理等操作。
以下是使用JChem进行分子结构搜索的示例代码:
```java
import chemaxon.formats.MolImporter;
import chemaxon.struc.Molecule;
import chemaxon.search.SearchException;
import chemaxon.search.MolSearchOptions;
import chemaxon.search.MolSearch;
public class JChemExample {
public static void main(String[] args) {
try {
// 导入查询分子
Molecule query = MolImporter.importMol("C1=CC=CC=C1");
// 导入目标分子
Molecule target = MolImporter.importMol("CC1=CC=CC=C1");
// 设置搜索选项
MolSearchOptions options = new MolSearchOptions();
options.setSearchType(MolSearchOptions.SEARCH_TYPE_SUBSTRUCTURE);
// 创建搜索对象并执行搜索
MolSearch search = new MolSearch(query, options);
boolean match = search.search(target);
// 输出搜索结果
if (match) {
System.out.println("目标分子包含查询分子结构");
} else {
System.out.println("目标分子不包含查询分子结构");
}
} catch (Exception e) {
e.printStackTrace();
}
}
}
```
在上面的代码中,我们使用了`MolImporter`类从字符串中导入了查询分子和目标分子,然后使用`MolSearch`类执行了分子结构搜索,并输出了搜索结果。
请注意,上面的示例只是JChem的基本用法之一。JChem还提供了许多其他功能,例如生成描述符、计算性质、化合物库管理等。如果你想深入了解JChem,请查阅官方文档或参考其他JChem相关的教程和示例代码。