请帮我写一段批量构建系统发育树的代码

好的，以下是一段 Python 代码，可以用于批量构建系统发育树：

import dendropy

# 定义函数，用于构建单个物种的系统发育树
def build_phylogeny(species_name, gene_sequence_file):
    # 读取基因序列文件
    gene_sequence = dendropy.DnaCharacterMatrix.get(
        path=gene_sequence_file,
        schema="fasta"
    )

    # 构建系统发育树
    tree = dendropy.Tree.get(
        data=gene_sequence,
        schema="fasta",
        taxon_namespace=dendropy.TaxonNamespace([species_name])
    )

    # 返回构建好的系统发育树
    return tree

# 定义函数，用于批量构建系统发育树
def build_phylogenies(species_data):
    # 定义空列表，用于存储所有系统发育树
    phylogenies = []

    # 遍历物种数据
    for species_name, gene_sequence_file in species_data.items():
        # 构建单个物种的系统发育树
        phylogeny = build_phylogeny(species_name, gene_sequence_file)

        # 将构建好的系统发育树添加到列表中
        phylogenies.append(phylogeny)

    # 返回所有构建好的系统发育树
    return phylogenies

# 定义物种数据，其中键为物种名称，值为基因序列文件路径
species_data = {
    "human": "human_genes.fasta",
    "mouse": "mouse_genes.fasta",
    "rat": "rat_genes.fasta"
}

# 构建所有物种的系统发育树
phylogenies = build_phylogenies(species_data)

# 打印所有系统发育树的摘要信息
for phylogeny in phylogenies:
    print(phylogeny.as_string("newick"))

以上代码中，`build_phylogeny` 函数用于构建单个物种的系统发育树，`build_phylogenies` 函数用于批量构建所有物种的系统发育树。`species_data` 变量定义了所有物种的基因序列文件路径，可以根据需要进行修改。最后，使用 `print` 函数打印所有系统发育树的摘要信息。