如果是在金属锌表面进行吸附一个有机分子呢?
时间: 2024-03-16 18:44:12 浏览: 113
行业分类-设备装置-一种金属有机骨架吸附材料表面改性方法.zip
在金属锌表面吸附有机分子的计算方法与上述步骤类似,但是需要注意以下几点:
1.选择合适的交换-相关泛函
对于含有有机分子的金属表面体系,通常需要选择合适的交换-相关泛函来计算体系的能量和电荷密度等性质。例如,可以采用GGA(广义梯度近似)泛函,如PBE泛函或PW91泛函,或者采用更高级别的泛函,如HSE06混合泛函等。
2.考虑溶剂效应
在实际的表面吸附过程中,通常会涉及到溶剂的存在。因此,需要在模拟中考虑溶剂效应。可以采用VASP中的NEB(能量势垒)计算方法,来模拟表面吸附过程中的溶剂效应。
3.选择合适的赝势
对于含有金属元素的体系,需要选择合适的赝势,以考虑核心电子的效应。在VASP中,可以采用多种类型的赝势,如PAW(投影缀加波)赝势等,以考虑金属锌的核心电子效应。
以下是针对金属锌表面吸附有机分子的一些参考代码:
1. 生成金属锌表面的超胞模型
```
Zn bulk
1.0
4.03000 0.00000 0.00000
0.00000 4.03000 0.00000
0.00000 0.00000 2.62000
Zn
4
direct
0.00000 0.00000 0.00000
0.50000 0.50000 0.00000
0.50000 0.00000 0.50000
0.00000 0.50000 0.50000
```
2. 初步结构优化
```
ISIF = 2
IBRION = 2
NSW = 100
POTIM = 0.2
```
3. 生成有机分子的POSCAR文件
```
Molecule
1.0
4.000000000000000
0.0000000000000000 0.0000000000000000 -0.6430000000000000
0.0000000000000000 0.0000000000000000 -1.4730000000000000
0.0000000000000000 0.0000000000000000 -2.3030000000000000
0.0000000000000000 -0.8710000000000000 -0.6430000000000000
0.0000000000000000 -0.8710000000000000 -1.4730000000000000
0.0000000000000000 -0.8710000000000000 -2.3030000000000000
0.0000000000000000 -1.7420000000000000 -0.6430000000000000
0.0000000000000000 -1.7420000000000000 -1.4730000000000000
0.0000000000000000 -1.7420000000000000 -2.3030000000000000
C N O
3 3 3
Direct
0.1761 0.0000 0.4731
0.1761 0.0000 0.3031
0.1761 0.0000 0.1331
0.0000 0.1761 0.4731
0.0000 0.1761 0.3031
0.0000 0.1761 0.1331
0.8239 0.0000 0.4731
0.8239 0.0000 0.3031
0.8239 0.0000 0.1331
0.0000 0.8239 0.4731
0.0000 0.8239 0.3031
0.0000 0.8239 0.1331
0.6761 0.1761 0.4731
0.6761 0.1761 0.3031
0.6761 0.1761 0.1331
0.3239 0.1761 0.4731
0.3239 0.1761 0.3031
0.3239 0.1761 0.1331
0.6761 0.8239 0.4731
0.6761 0.8239 0.3031
0.6761 0.8239 0.1331
0.3239 0.8239 0.4731
0.3239 0.8239 0.3031
0.3239 0.8239 0.1331
```
4. 计算吸附能
使用VASP计算出金属锌表面,有机分子,以及表面-分子复合体的能量,并计算出吸附能。
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