用R语言实现印第安人糖尿病的朴素贝叶斯KNN分类并画图考察其训练误差与交叉验证,计算预测准确率

时间: 2024-06-09 15:09:46 浏览: 100
首先,我们需要准备数据集。这里我们使用UCI Machine Learning Repository的Pima Indians Diabetes数据集。 ```R # 导入数据集 data <- read.csv("https://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/pima-indians-diabetes/pima-indians-diabetes.data") # 将数据集分为训练集和测试集 set.seed(123) trainIndex <- sample(1:nrow(data), 0.7*nrow(data)) train <- data[trainIndex,] test <- data[-trainIndex,] ``` 接下来,我们需要对数据进行预处理,将数据集分为特征和标签,并且将特征进行标准化。 ```R # 分离特征和标签 train_x <- train[,-9] train_y <- train[,9] test_x <- test[,-9] test_y <- test[,9] # 特征标准化 train_x <- scale(train_x) test_x <- scale(test_x) ``` 然后,我们可以使用knn和naivebayes库分别建立knn和朴素贝叶斯模型,并计算训练误差和交叉验证误差。 ```R library(knn) library(naivebayes) # KNN模型 knn_model <- knn(train_x, test_x, train_y, k = 5) # 计算训练误差 train_error_knn <- mean(train_y != knn(train_x, train_x, train_y, k = 5)) # 计算交叉验证误差 cv_error_knn <- knn.cv(train_x, train_y, k = 5)$cv.error # 朴素贝叶斯模型 nb_model <- naive_bayes(train_x, train_y) # 计算训练误差 train_error_nb <- mean(train_y != predict(nb_model, train_x)) # 计算交叉验证误差 cv_error_nb <- cv_performance(nb_model)$error.rate # 输出结果 cat("KNN模型的训练误差为:", train_error_knn, "\n") cat("KNN模型的交叉验证误差为:", cv_error_knn, "\n") cat("朴素贝叶斯模型的训练误差为:", train_error_nb, "\n") cat("朴素贝叶斯模型的交叉验证误差为:", cv_error_nb, "\n") ``` 最后,我们可以使用混淆矩阵计算预测准确率。 ```R # 计算预测准确率 library(caret) confusionMatrix(knn_model, test_y)$overall['Accuracy'] confusionMatrix(predict(nb_model, test_x), test_y)$overall['Accuracy'] ``` 我们可以将训练误差和交叉验证误差绘制成图表,以便更好地观察模型的性能表现。 ```R library(ggplot2) # 绘制训练误差和交叉验证误差 error_data <- data.frame( model = c("KNN", "Naive Bayes"), train_error = c(train_error_knn, train_error_nb), cv_error = c(cv_error_knn, cv_error_nb) ) error_data <- melt(error_data, id.vars = "model", variable.name = "error_type", value.name = "error") ggplot(error_data, aes(x = model, y = error, fill = error_type)) + geom_bar(stat = "identity", position = "dodge") + theme(legend.position = "top") + labs(title = "Training error and cross-validation error", x = "Model", y = "Error rate") ``` 这样,我们就完成了印第安人糖尿病数据集的朴素贝叶斯KNN分类,并且计算了训练误差、交叉验证误差和预测准确率。
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