rt=read.table(paste0(A,".txt"),header=F,sep="\t",check.names=F) Error in paste0(A, ".txt") : object 'A' not found
时间: 2023-11-13 11:04:01 浏览: 32
```python
# -*- coding: utf-8 -*-
"""
Created on Wed Nov 25 15:52:51 2020
@author:
"""
Fib = [1.0, 1.0] # 初始化前两个元素为1
for i in range(2, 20): # 计算Fibonacci数列
Fib.append(Fib[i-1]+Fib[i-2])
print("Fibonacci数列为:") # 输出Fibonacci数列
for i in range(20):
print("%d" % Fib[i], end="\t") # 每个数输出后加制表符
if (i+1) % 4 == 0: # 每行输出4个数
print() # 输出换行符
```
程序运行截图:
![image-20201125160724312](https://cdn.jsdelivr.net/gh/Wallace-0/PicBed/img/20201125160726.png)
相关问题
Error in paste0("PETCTfution_XGBAUC_output", i) = rbind.data.frame(paste0(i, :
这个错误提示通常是因为你在使用`paste0()`函数时使用了赋值操作符`=`而不是`<-`,导致语法出错。
如果你想要将`rbind.data.frame()`函数的结果赋值给一个新的变量,应该使用`<-`操作符,例如:
```
new_df <- rbind.data.frame(paste0(i, "PETCTfution_XGBAUC_output"), new_row)
```
如果你想要将结果添加到一个现有的变量中,可以使用`=`操作符,例如:
```
existing_df = rbind.data.frame(existing_df, new_row)
```
注意,在R语言中,`=`和`<-`操作符有不同的作用,`=`通常用于函数参数的赋值,而`<-`用于变量的赋值。
library(limma) library(sva) setwd("D:\\exoRBase\\circRNA") #???ù???Ŀ¼ inputFile="circRNA_exp.txt" #?????ļ? pFilter=0.05 #pvalue?ٽ?ֵ logFCfilter=0 #logFC?ٽ?ֵ conGroup="Healthy" #???????ؼ??? treatGroup="MEL" #ʵ?????ؼ??? #??ȡ?????ļ? outTab=data.frame() rt=read.table(inputFile,sep="\t",header=T,check.names=F) rt=as.matrix(rt) rownames(rt)=rt[,1] exp=rt[,2:ncol(rt)] dimnames=list(rownames(exp),colnames(exp)) data=matrix(as.numeric(as.matrix(exp)),nrow=nrow(exp),dimnames=dimnames) data=avereps(data) conCol=grep(paste0("^",conGroup,"\\d+"),colnames(data)) #??ȡ??????????�� treatCol=grep(paste0("^",treatGroup,"\\d+"),colnames(data)) #??ȡʵ????????�� conData=data[,conCol] treatData=data[,treatCol] data=cbind(conData,treatData) conNum=ncol(conData) treatNum=ncol(treatData) data=data[rowMeans(data)>0.5,] group=c(rep(1,conNum),rep(2,treatNum)) data=ComBat(data, group,par.prior=TRUE) data[data<0]=0 这段代码运行后提示:Found 12311 genes with uniform expression within a single batch (all zeros); these will not be adjusted for batch. Found2batches Adjusting for0covariate(s) or covariate level(s) Standardizing Data across genes Fitting L/S model and finding priors Finding parametric adjustments Adjusting the Data 为什么?
这段代码提示的信息是关于使用limma和sva包进行批次调整的过程。提示中的信息表明,在进行批次调整时,发现了12311个基因在单个批次中表达一致(全为零),因此它们不会被用于批次调整。同时,还发现了2个批次,需要进行调整。
这个提示信息是正常的输出,它表示代码已经开始执行批次调整的步骤。在进行批次调整过程中,会对数据进行标准化、拟合模型、找到先验概率等操作,以进行数据调整。
如果您对这个过程有进一步的疑问或需要更详细的解释,请提供更多的上下文信息或具体问题。
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