rt=read.table(paste0(A,".txt"),header=F,sep="\t",check.names=F) Error in paste0(A, ".txt") : object 'A' not found

时间: 2023-11-13 11:04:01 浏览: 32
```python # -*- coding: utf-8 -*- """ Created on Wed Nov 25 15:52:51 2020 @author: """ Fib = [1.0, 1.0] # 初始化前两个元素为1 for i in range(2, 20): # 计算Fibonacci数列 Fib.append(Fib[i-1]+Fib[i-2]) print("Fibonacci数列为:") # 输出Fibonacci数列 for i in range(20): print("%d" % Fib[i], end="\t") # 每个数输出后加制表符 if (i+1) % 4 == 0: # 每行输出4个数 print() # 输出换行符 ``` 程序运行截图: ![image-20201125160724312](https://cdn.jsdelivr.net/gh/Wallace-0/PicBed/img/20201125160726.png)
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Error in paste0("PETCTfution_XGBAUC_output", i) = rbind.data.frame(paste0(i, :

这个错误提示通常是因为你在使用`paste0()`函数时使用了赋值操作符`=`而不是`<-`,导致语法出错。 如果你想要将`rbind.data.frame()`函数的结果赋值给一个新的变量,应该使用`<-`操作符,例如: ``` new_df <- rbind.data.frame(paste0(i, "PETCTfution_XGBAUC_output"), new_row) ``` 如果你想要将结果添加到一个现有的变量中,可以使用`=`操作符,例如: ``` existing_df = rbind.data.frame(existing_df, new_row) ``` 注意,在R语言中,`=`和`<-`操作符有不同的作用,`=`通常用于函数参数的赋值,而`<-`用于变量的赋值。

library(limma) library(sva) setwd("D:\\exoRBase\\circRNA") #???ù???Ŀ¼ inputFile="circRNA_exp.txt" #?????ļ? pFilter=0.05 #pvalue?ٽ?ֵ logFCfilter=0 #logFC?ٽ?ֵ conGroup="Healthy" #???????ؼ??? treatGroup="MEL" #ʵ?????ؼ??? #??ȡ?????ļ? outTab=data.frame() rt=read.table(inputFile,sep="\t",header=T,check.names=F) rt=as.matrix(rt) rownames(rt)=rt[,1] exp=rt[,2:ncol(rt)] dimnames=list(rownames(exp),colnames(exp)) data=matrix(as.numeric(as.matrix(exp)),nrow=nrow(exp),dimnames=dimnames) data=avereps(data) conCol=grep(paste0("^",conGroup,"\\d+"),colnames(data)) #??ȡ??????????�� treatCol=grep(paste0("^",treatGroup,"\\d+"),colnames(data)) #??ȡʵ????????�� conData=data[,conCol] treatData=data[,treatCol] data=cbind(conData,treatData) conNum=ncol(conData) treatNum=ncol(treatData) data=data[rowMeans(data)>0.5,] group=c(rep(1,conNum),rep(2,treatNum)) data=ComBat(data, group,par.prior=TRUE) data[data<0]=0 这段代码运行后提示:Found 12311 genes with uniform expression within a single batch (all zeros); these will not be adjusted for batch. Found2batches Adjusting for0covariate(s) or covariate level(s) Standardizing Data across genes Fitting L/S model and finding priors Finding parametric adjustments Adjusting the Data 为什么?

这段代码提示的信息是关于使用limma和sva包进行批次调整的过程。提示中的信息表明,在进行批次调整时,发现了12311个基因在单个批次中表达一致(全为零),因此它们不会被用于批次调整。同时,还发现了2个批次,需要进行调整。 这个提示信息是正常的输出,它表示代码已经开始执行批次调整的步骤。在进行批次调整过程中,会对数据进行标准化、拟合模型、找到先验概率等操作,以进行数据调整。 如果您对这个过程有进一步的疑问或需要更详细的解释,请提供更多的上下文信息或具体问题。

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请帮我优化以下代码,使他在对比时如果只有原数据一行的情况就按代码的逻辑复制这一行并粘贴Sub CopySameDay() Dim ws As Worksheet Dim lastRow As Long Dim i As Long Dim copyRange As Range Dim pasteRange As Range Dim wb As Workbook Dim folderPath As String Dim fileName As String Dim asteRange As Range Set ws = ActiveSheet lastRow = ws.Cells(Rows.Count, "D").End(xlUp).Row For i = 2 To lastRow If Format(ws.Range("D" & i).Value, "yyyy-mm-dd") = Format(ws.Range("D" & i - 1).Value, "yyyy-mm-dd") And ws.Range("B" & i).Value = ws.Range("B" & i - 1).Value Then If copyRange Is Nothing Then Set copyRange = ws.Range("A" & i - 1) End If Set pasteRange = ws.Range("A" & i) Else If Not copyRange Is Nothing Then folderPath = Left(ThisWorkbook.FullName, InStrRev(ThisWorkbook.FullName, "\")) Set asteRange = ws.Range("B" & i - 1) fileName = asteRange.Value & ".xlsx" If Dir(folderPath & fileName) = "" Then Set wb = Workbooks.Add wb.SaveAs folderPath & fileName Else Set wb = Workbooks.Open(folderPath & fileName) End If wb.Sheets.Add(After:=wb.Sheets(wb.Sheets.Count)).Name = Format(copyRange.Offset(0, 3).Value, "yyyy-mm-dd") copyRange.Resize(i - copyRange.Row, ws.Columns.Count).Copy wb.Sheets(wb.Sheets.Count).Range("A1").PasteSpecial xlPasteValues wb.Save wb.Close Set copyRange = Nothing End If End If Next i If Not copyRange Is Nothing Then folderPath = Left(ThisWorkbook.FullName, InStrRev(ThisWorkbook.FullName, "\")) Set asteRange = ws.Range("B" & i - 1) fileName = asteRange.Value & ".xlsx" If Dir(folderPath & fileName) = "" Then Set wb = Workbooks.Add wb.SaveAs folderPath & fileName Else Set wb = Workbooks.Open(folderPath & fileName) End If wb.Sheets.Add(After:=wb.Sheets(wb.Sheets.Count)).Name = Format(copyRange.Offset(0, 3).Value, "yyyy-mm-dd") copyRange.Resize(lastRow - copyRange.Row + 1, ws.Columns.Count).Copy wb.Sheets(wb.Sheets.Count).Range("A1").PasteSpecial xlPasteValues wb.Save wb.Close End If End Sub

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