如何利用多实例学习对WSI图像进行分割
时间: 2023-11-11 19:41:32 浏览: 232
在线图像标注工具,矩形、多边形等等,可用于深度学习实例分割模型训练(Mask R-CNN)+源代码+文档说明
利用多实例学习(Multiple Instance Learning, MIL)对WSI(Whole Slide Imaging)图像进行分割的一般步骤如下:
1. 数据准备:
- 获取WSI图像数据集,其中每个WSI图像可能包含多个区域,每个区域可能包含多个实例(例如细胞)。
- 对每个WSI图像,标注出感兴趣区域(Region of Interest, ROI)以及相应的实例标签。
2. 特征提取:
- 针对每个ROI,提取特征来表示该区域的视觉信息。常用的特征包括颜色直方图、纹理特征、形状特征等。
3. 实例级别标签生成:
- 对于每个ROI,根据其中的实例标签生成一个实例级别的标签。有多种方法可用,例如:包含正样本的ROI标记为正例,不包含正样本但包含负样本的ROI标记为不确定例,不包含任何样本的ROI标记为负例。
4. 多实例学习模型训练:
- 使用MIL算法进行模型训练。MIL是一种弱监督学习算法,其中每个训练样本都由一个或多个实例组成,并且样本级别的标签只有正例和负例。
- 常用的MIL算法包括经典的MIL算法、MIL with Multiple Instance Representation (MIL-MIR)等。
5. 分割预测:
- 对于新的WSI图像,首先对其进行分割,得到多个ROI。
- 对于每个ROI,提取特征,并使用训练好的MIL模型进行预测。根据预测结果,可以得到每个ROI的实例级别的标签。
需要注意的是,WSI图像的分割是一个复杂任务,常常需要使用深度学习等方法,并结合大量的标注数据和计算资源来训练和优化模型。同时,还需要根据具体应场景进行一些调整和改进,以获得更好的分割效果。
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