在4.1.3版本的R语言中建立加权有向ergm模型,模型中的变量包含边和几何几何加权二元共享伙伴,参照分布项设置为泊松分布,借助MCMCpack包对模型分别使用MH采样函数以及Gibbs采样函数下的MCMC算法进行参数估计,迭代1000次,并且绘制后验密度图、迭代轨迹图、自相关图像
时间: 2024-02-05 21:13:20 浏览: 46
2017_2018学年高中数学第四章导数及其应用4.1导数概念4.1.3导数的概念和几何意义分层训练湘教版选修2_2
以下是使用MCMCpack包在R语言中建立加权有向ergm模型,并使用MH采样函数以及Gibbs采样函数下的MCMC算法进行参数估计的代码。请注意,这里的数据是模拟数据,仅用于演示目的。
```R
library(MCMCpack)
# 创建模拟数据
set.seed(123)
n <- 50
y <- matrix(rbinom(n^2, 1, 0.3), ncol=n)
g <- matrix(rnorm(n^2), ncol=n)
w <- exp(-g^2/2)
y[w < 0.5] <- 0
# 构建加权有向ergm模型
model <- ergm(y ~ edges + gwesp(0.5, fixed=T),
constraint="noncrossing",
control=control.ergm(seed=123),
response="Poisson")
# 使用MH采样函数进行MCMC估计
set.seed(123)
res_MH <- mcmc(model, n=1000, method="MH", thin=10)
# 使用Gibbs采样函数进行MCMC估计
set.seed(123)
res_Gibbs <- mcmc(model, n=1000, method="Gibbs", thin=10)
# 绘制后验密度图
par(mfrow=c(1,2))
plot(density(res_MH$theta[,1]), main="Posterior density (MH)")
plot(density(res_Gibbs$theta[,1]), main="Posterior density (Gibbs)")
# 绘制迭代轨迹图
par(mfrow=c(2,2))
plot(res_MH$theta[,1], type="l", main="Trace plot (MH)")
plot(res_MH$theta[,2], type="l", main="Trace plot (MH)")
plot(res_Gibbs$theta[,1], type="l", main="Trace plot (Gibbs)")
plot(res_Gibbs$theta[,2], type="l", main="Trace plot (Gibbs)")
# 绘制自相关图像
par(mfrow=c(2,2))
acf(res_MH$theta[,1], main="ACF plot (MH)")
acf(res_MH$theta[,2], main="ACF plot (MH)")
acf(res_Gibbs$theta[,1], main="ACF plot (Gibbs)")
acf(res_Gibbs$theta[,2], main="ACF plot (Gibbs)")
```
这段代码首先使用MCMCpack包中的`ergm()`函数构建加权有向ergm模型,其中约束条件为“noncrossing”,分布项设置为泊松分布。然后使用`mcmc()`函数对模型分别进行MH采样和Gibbs采样,并迭代1000次,每10次进行一次thin操作。最后,使用`plot()`函数绘制后验密度图、迭代轨迹图和自相关图像。
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