DataFrame 的corr()函数求P值
时间: 2024-05-14 07:19:04 浏览: 201
DataFrame的corr()函数并不能直接求出P值,它只能计算出两个变量之间的相关系数值。如果需要求出相关系数的P值,可以使用scipy中的pearsonr()函数。
例如,假设有一个DataFrame df,需要计算其中两列'A'和'B'之间的相关系数及P值,可以使用以下代码:
```python
from scipy.stats import pearsonr
corr_coef, p_value = pearsonr(df['A'], df['B'])
print('相关系数:', corr_coef)
print('P值:', p_value)
```
其中,pearsonr()函数返回两个值,第一个值为相关系数,第二个值为对应的P值。
相关问题
df计算整个dataframe的相关系数矩阵及P值
在Python的数据分析库pandas中,如果你有一个DataFrame `df`,可以使用`corr()`函数来计算整个DataFrame内各列之间的一组皮尔逊相关系数。同时,它还会生成一个包含P值的表格。下面是一个例子:
```python
import pandas as pd
import numpy as np
from statsmodels.sandbox.stats.multicomp import multipletests
# 假设 df 是一个 pandas DataFrame
df = pd.DataFrame(np.random.rand(100, 5), columns=['A', 'B', 'C', 'D', 'E'])
# 使用 .corr() 获取相关系数矩阵
correlation_matrix = df.corr()
# P值通常由 corr() 自动计算,但默认不显示。我们可以手动计算并添加:
# 提取系数数据(忽略对角线,因为对角线相关系数为1)
correlation_data = correlation_matrix.values[:-1, :-1]
# 对数据进行假设检验,得到显著性水平(通常是0.05)下的p值
p_values = np.ones_like(correlation_data)
_, p_values, _, _ = multipletests(correlation_data.flatten(), alpha=0.05, method='bonferroni')
# 将p值转换回原来的形状,并放在原矩阵的下方
p_values = pd.DataFrame(p_values.reshape(*correlation_matrix.shape), index=correlation_matrix.index[:-1], columns=correlation_matrix.columns[:-1])
# 结果数据框将包含相关系数和p值
correlation_results = pd.concat([correlation_matrix, p_values], axis=1)
print(correlation_results)
```
这段代码首先计算了皮尔逊相关系数,然后使用`multipletests`函数进行了多比较校正(如Bonferroni修正),得到了显著性的p值。
python多变量相关p值
要计算多个变量之间的相关性,可以使用皮尔逊相关系数。在 Python 中,可以使用 `scipy.stats` 模块中的 `pearsonr` 函数来计算两个变量之间的相关系数及其对应的 p 值。如果要计算多个变量之间的相关性,可以使用 pandas 库中的 `corr` 函数,该函数可以计算多个变量之间的相关系数矩阵。对于相关系数矩阵,可以使用 `numpy` 中的 `corrcoef` 函数来计算对应的 p 值。具体实现可以参考以下代码:
```python
import pandas as pd
import numpy as np
from scipy.stats import pearsonr
# 创建数据集
data = {'var1': [1, 2, 3, 4, 5],
'var2': [2, 4, 6, 8, 10],
'var3': [3, 6, 9, 12, 15]}
df = pd.DataFrame(data)
# 计算相关系数矩阵
corr_matrix = df.corr()
# 计算对应的 p 值
p_values = np.zeros_like(corr_matrix)
for i in range(corr_matrix.shape[0]):
for j in range(i+1, corr_matrix.shape[1]):
corr, p = pearsonr(df.iloc[:, i], df.iloc[:, j])
p_values[i, j] = p
p_values[j, i] = p
print(corr_matrix)
print(p_values)
```
输出结果为:
```
var1 var2 var3
var1 1.000000 1.000000 1.000000
var2 1.000000 1.000000 1.000000
var3 1.000000 1.000000 1.000000
[[0. 0. 0. ]
[0. 0. 0. ]
[0. 0. 0. ]]
```
由于数据集中的变量之间完全相关,因此相关系数为 1,对应的 p 值为 0。
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