ERCC外源标准RNA的应用,
时间: 2023-08-07 16:48:31 浏览: 218
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ERCC(External RNA Controls Consortium)外源标准RNA是一组由美国生物技术公司Ambion(现在已被Thermo Fisher Scientific收购)开发的外源RNA标准物质,用于对RNA测序数据的准确性和可靠性进行校验和标准化。ERCC标准RNA由92个人工合成的RNA分子组成,这些RNA分子的序列和长度均已知,并且在不同样品和实验条件下表现出稳定的表达水平。
ERCC标准RNA的应用主要包括以下几个方面:
1. RNA测序数据标准化:将ERCC标准RNA加入RNA样品中进行测序,可以通过对ERCC标准RNA的表达量进行计算,将不同样品之间的RNA表达量进行标准化,从而消除不同样品之间的技术差异和批次效应。
2. 测序深度估算:通过将不同浓度的ERCC标准RNA加入RNA样品中,可以评估RNA测序数据的深度和覆盖度,并优化测序深度以达到所需的测序覆盖度。
3. 测序质量控制:ERCC标准RNA可以用于评估RNA测序数据的准确性和可靠性,检测测序数据中的技术偏差和误差,并优化RNA测序实验的质量控制流程。
4. 生物标记物筛选:ERCC标准RNA可以用作生物标记物筛选的参考,帮助筛选出稳定的、可靠的生物标记物,并评估生物标记物的表达稳定性和差异性。
总之,ERCC标准RNA是RNA测序数据标准化和质量控制的重要工具,可以提高RNA测序数据的准确性和可靠性,为RNA测序数据的分析和解释提供更可靠的基础。
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