ANIclustermap -i ./normal_dataset -o ./ANIclustermap_result \ --fig_width 15 --cmap_gamma 0.5
时间: 2024-03-30 10:36:41 浏览: 87
这段代码是 ANIclustermap 工具的命令行参数,用于生成一个聚类热图。具体来说,它的含义如下:
- -i ./normal_dataset 指定输入的数据集路径为当前目录下的 normal_dataset 文件夹。
- -o ./ANIclustermap_result 指定输出结果路径为当前目录下的 ANIclustermap_result 文件夹。
- --fig_width 15 指定生成的聚类热图的宽度为 15 个单位(默认为 7.5)。
- --cmap_gamma 0.5 指定颜色映射的 gamma 值为 0.5,用于调整颜色的亮度和对比度。
ANIclustermap 工具可以用来分析基因组序列的相似性和进化关系,并生成聚类热图以可视化结果。
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