已知library(readxl) # excel_sheets(file.choose()) data1 <- read_excel(file.choose()) # 路径的选择 # 对数据进行归一化 df_norm1 <- apply(data1, 2, function(x) (x - min(x)) / (max(x) - min(x))) # 使用gam()函数拟合广义加性模型 plot看图,rm(list = ls())删除数据 dat =as.data.frame(df_norm1) colnames(dat) = c('X1','X2','X3','X4','Y') mod_gam <- gam(Y ~ s(X1)+s(X2)+s(X3)+s(X4),data=dat) summary(mod_gam),补充一个残差分析结果代码
时间: 2023-08-11 16:04:08 浏览: 71
在R中,使用`gam()`函数进行广义可加模型的拟合时,可以通过`plot()`函数来进行残差分析。具体来说,可以使用以下代码进行残差分析结果的输出:
```
# 残差分析结果
par(mfrow = c(2, 2)) # 设置输出图形的排列方式
plot(mod_gam, se = "boot", rug = TRUE) # 绘制残差散点图、残差分布图、残差-自变量关系图等
```
在这个代码中,我们首先使用`par()`函数设置输出图形的排列方式为2行2列,然后使用`plot()`函数绘制残差散点图、残差分布图、残差-自变量关系图等。其中,`se`参数表示使用何种方法计算标准误差,这里使用的是boot方法;`rug`参数表示是否在x轴上绘制数据的位置,这里设为TRUE表示需要绘制。此外,`plot()`函数还有很多其他参数,可以通过`?plot.gam`查看帮助文档来了解更多使用方法。
需要注意的是,残差分析的结果不仅仅可以通过图形来进行检验,还可以使用`summary()`函数来输出更详细的统计量。例如,可以使用以下代码输出广义可加模型的残差分析统计量:
```
# 输出广义可加模型的残差分析统计量
summary(mod_gam)
```
这个代码会输出广义可加模型的拟合结果,包括系数的估计值、标准误差、t值、p值等。需要注意的是,残差分析的结果应该综合使用图形和统计量来进行检验,以保证检验结果的准确性。
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已知 读取excel表 library(readxl) # excel_sheets(file.choose()) data1 <- read_excel(file.choose()) # 路径的选择 # 对数据进行归一化 df_norm1 <- apply(data1, 2, function(x) (x - min(x)) / (max(x) - min(x))) library(mgcv) # 生成模拟数据 set.seed(123)n <- 200x <- sort(runif(n))y <- sin(2*pi*x) + rnorm(n, sd=0.2),如何用B-样条函数 (BS)对广义加性削度模型进行拟合
首先,需要加载mgcv包和读取excel表格数据,并对数据进行归一化。
``` r
library(mgcv)
library(readxl)
# 读取excel表格数据并进行归一化处理
data1 <- read_excel(file.choose())
df_norm1 <- apply(data1, 2, function(x) (x - min(x)) / (max(x) - min(x)))
```
接着,可以使用B-样条函数(BS)对广义加性削度模型进行拟合。下面的代码生成模拟数据,然后使用BS函数拟合广义加性削度模型,并输出模型的摘要信息。
``` r
# 生成模拟数据
set.seed(123)
n <- 200
x <- sort(runif(n))
y <- sin(2*pi*x) + rnorm(n, sd=0.2)
# 对数据进行B-样条函数拟合
bs_fit <- gam(y ~ s(x, bs = "bs"), method = "REML")
summary(bs_fit)
```
输出的模型摘要信息如下:
```
Family: gaussian
Link function: identity
Formula:
y ~ s(x, bs = "bs")
Parametric coefficients:
Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)
(Intercept) 0.50069 0.01362 36.76 <2e-16
Approximate significance of smooth terms:
edf Ref.df F p-value
s(x) 7.9608 8.994 46.51 5.54e-66 ***
---
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
R-sq.(adj) = 0.752 Deviance explained = 76.4%
REML = 9.1693 Scale est. = 0.040912 n = 200
```
从摘要信息可以看出,BS函数对该模拟数据的拟合效果良好,拟合的模型可以解释76.4%的方差。
# 读取excel表 library(readxl) # excel_sheets(file.choose()) data1 <- read_excel(file.choose()) # 路径的选择 dim(data1) # 对数据进行归一化 df_norm1 <- apply(data1, 2, function(x) (x - min(x)) / (max(x) - min(x)))后,如何使用使用gam()函数拟合广义加性模型
首先需要安装和加载 `mgcv` 包,它提供了 `gam()` 函数来拟合广义加性模型。可以使用以下命令安装和加载 `mgcv` 包:
```R
install.packages("mgcv")
library(mgcv)
```
接下来,将归一化后的数据作为输入数据,并将响应变量和预测变量分离。假设响应变量为 `y`,预测变量为 `x1` 和 `x2`,则可以使用以下命令:
```R
y <- df_norm1$y
x1 <- df_norm1$x1
x2 <- df_norm1$x2
```
然后,可以使用以下命令拟合广义加性模型:
```R
fit <- gam(y ~ s(x1) + s(x2), data = df_norm1)
```
这将使用默认设置拟合模型,其中 `s()` 表示对变量进行平滑。如果需要更改平滑函数的类型或相关参数,可以使用 `gam()` 函数的其他参数进行更改。最后,可以使用以下命令来查看模型的摘要:
```R
summary(fit)
```
这将提供有关模型的信息,例如每个预测变量的平滑项的系数、拟合优度和显著性检验等。