如何用R语言绘制具有显著性的带样点的箱型图

1. 准备数据：首先需要准备数据，数据应该包含一个分类变量和一个连续变量。例如，我们可以使用R内置的iris数据集。

2. 绘制箱型图：使用ggplot2库绘制箱型图，并使用geom_boxplot()函数绘制箱型图。如下所示：

library(ggplot2)
ggplot(iris, aes(x = Species, y = Sepal.Length)) + geom_boxplot()

3. 添加样点：为了添加样点，我们可以使用geom_jitter()函数。此函数将样点添加到每个箱型图上。我们可以使用不同的参数来调整样点的大小、形状和颜色。

ggplot(iris, aes(x = Species, y = Sepal.Length)) + 
  geom_boxplot() +
  geom_jitter(width = 0.2, size = 2, color = "red")

4. 添加显著性标识：为了添加显著性标识，我们可以使用geom_signif()函数。此函数将在箱型图之间添加显著性标识。我们可以使用不同的参数来调整显著性标识的位置和颜色。

ggplot(iris, aes(x = Species, y = Sepal.Length)) + 
  geom_boxplot() +
  geom_jitter(width = 0.2, size = 2, color = "red") +
  geom_signif(comparisons = list(c("setosa", "versicolor")), 
              map_signif_level = TRUE, 
              textsize = 6, 
              vjust = -1)

上述代码中，我们将显著性标识添加到setosa和versicolor之间的箱型图。显著性水平将自动计算，并且将在显著性标识的顶部显示。显著性标识的文本大小和垂直位置也可以调整。