jupyter中如何计算模板分子的分子描述符的代码
时间: 2024-06-10 15:07:44 浏览: 152
你可以使用RDKit这个开源化学信息软件包来计算分子描述符,具体代码如下:
```python
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import AllChem
# 将SMILES字符串转化为分子对象
mol = Chem.MolFromSmiles('SMILES字符串')
# 计算分子的描述符
descs = AllChem.GetMorganFingerprintAsBitVect(mol, 2, nBits=1024)
# 将计算结果转化为numpy数组
descs_arr = descs.ToBitString()
```
请注意,这段代码只是提供了计算分子描述符的示例,并不代表这是模板分子的分子描述符。
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jupyter中计算模板分子的分子描述符
好的,这是一个与化学有关的问题。在Jupyter中,您可以使用RDKit等Python库计算化学分子的分子描述符。常见的分子描述符包括:分子量、极性表面积、荷电字典等。您可以使用以下代码进行计算:
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import Descriptors
mol = Chem.MolFromSmiles('CCC')
mol_weight = Descriptors.MolWt(mol)
polar_sa = Descriptors.TPSA(mol)
请注意,这只是一个示例代码,您可以根据您的实际需求进行修改。希望这可以帮助您!
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