编写代码，编写程序，读取一个文件的所有内容， 并在每行的行尾加上了行号后， 保存在一个新文件中。

以下是 Python 代码实现：

# 设置输入文件和输出文件名
input_file = "input.txt"
output_file = "output.txt"

# 打开输入文件和输出文件
with open(input_file, "r") as f_in, open(output_file, "w") as f_out:
    # 逐行读取输入文件并添加行号
    for i, line in enumerate(f_in):
        # 去除每行末尾的换行符
        line = line.rstrip("\n")
        # 将行号和内容拼接成新的字符串
        new_line = "{:03d}: {}".format(i+1, line)
        # 将新字符串写入输出文件
        f_out.write(new_line + "\n")

该程序首先定义了输入文件和输出文件的文件名，然后使用 `with` 语句打开这两个文件。在 `with` 语句块内部，程序使用 `enumerate()` 函数逐行读取输入文件，同时为每一行添加行号。添加行号后，程序将新的字符串写入输出文件。最后，程序自动关闭了输入文件和输出文件。