用docker安装vep

要使用 Docker 安装 VEP，请按照以下步骤操作：

1. 下载并安装 Docker。

2. 从 Docker Hub 上拉取 VEP 镜像。可以使用以下命令拉取最新版本：

   docker pull ensemblorg/ensembl-vep

3. 运行 VEP 容器。可以使用以下命令启动容器：

   docker run -t -i ensemblorg/ensembl-vep vep --help

该命令将在容器中启动 VEP，并且 `--help` 参数将打印出 VEP 的帮助信息。您可以使用其他 VEP 参数替换 `--help` 参数以运行 VEP。

注意：在运行 VEP 容器时，您可能需要映射本地文件夹到容器中以便 VEP 可以访问输入和输出文件。您可以使用 `-v` 参数来映射文件夹。例如：

docker run -t -i -v /path/to/local/folder:/path/to/container/folder ensemblorg/ensembl-vep vep --input_file /path/to/container/folder/input.vcf --output_file /path/to/container/folder/output.vcf

这将映射本地文件夹 `/path/to/local/folder` 到容器中的 `/path/to/container/folder` 文件夹，并将输入文件 `input.vcf` 和输出文件 `output.vcf` 放在容器中的映射文件夹中。