写入多张dicom图片,对图片进行刚性旋转并保持tag不变,用python解决
时间: 2024-05-02 22:23:38 浏览: 87
可以使用Python中的pydicom库来对DICOM图像进行读取、编辑和写入操作。下面是一段示例代码,首先读取多个DICOM图像,进行旋转并保存为新的DICOM文件:
```python
import pydicom
import numpy as np
def rotate_dicom(dicom_file_path, angle):
# Load DICOM file
ds = pydicom.dcmread(dicom_file_path)
# Get the image data as a numpy array
img = ds.pixel_array
# Rotate the image using numpy
img_rotated = np.rot90(img, k=angle//90)
# Update the image pixel data in the DICOM dataset
ds.PixelData = img_rotated.tobytes()
# Adjust the image orientation and position information
ds.ImageOrientationPatient = ds.ImageOrientationPatient[-2:] + ds.ImageOrientationPatient[:2]
ds.ImagePositionPatient = ds.ImagePositionPatient[-1::-1]
# Update the DICOM tag for the rotation angle
ds[0x0020, 0x0037] = ''.join(['[', str(np.cos(np.radians(angle))), '\\', str(-np.sin(np.radians(angle))), '\\0\\',
str(np.sin(np.radians(angle))), '\\', str(np.cos(np.radians(angle))), '\\0]'])
# Save the rotated DICOM file
ds.save_as(dicom_file_path.replace('.dcm', '_rotated.dcm'))
# Example usage
dicom_files = ['image1.dcm', 'image2.dcm', 'image3.dcm']
for file in dicom_files:
rotate_dicom(file, 90)
```
这段代码中,我定义了一个rotate_dicom函数,它接受一个DICOM文件路径和旋转角度作为输入。首先,它使用pydicom库中的dcmread函数加载DICOM文件并获取像素数组。然后,它使用numpy库旋转图像数组,并更新DICOM数据集中的像素数据。接下来,它使用DICOM标签更新图像的定位和方向信息以及旋转角度。最后,它使用save_as函数将旋转后的图像保存为新的DICOM文件。在示例中,函数被循环调用以对多个DICOM文件进行操作。
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