python实现pca降维_PCA降维的原理、方法、以及python实现。
时间: 2023-08-07 12:02:29 浏览: 31
PCA(Principal Component Analysis)是一种常用的数据降维方法,它可以将高维数据转化为低维数据,同时尽可能地保留原始数据的特征信息。
PCA的核心思想是通过线性变换将原始数据映射到新的坐标系中,使得新坐标系下的数据具有最大的方差。换句话说,PCA通过找到数据中最具有代表性的方向(主成分),来实现降维的目的。
下面介绍PCA的具体实现方法:
1. 计算数据的协方差矩阵
对于一个含有n个样本的数据集,假设每个样本都是d维向量,则数据的协方差矩阵为:S = 1/n * Σ(xi-μ)(xi-μ)^T,其中μ是所有样本的均值向量。
2. 计算协方差矩阵的特征值和特征向量
对协方差矩阵进行特征值分解,得到特征值λ1, λ2, …, λd和对应的特征向量v1, v2, …, vd。
3. 选择前k个主成分
将特征值从大到小排序,选择前k个特征值对应的特征向量,这些特征向量组成一个d×k的矩阵,称为投影矩阵。
4. 将数据投影到新的坐标系中
将原始数据x乘以投影矩阵,即可将d维数据投影到k维空间中,从而实现降维的目的。
下面给出Python代码实现PCA:
```python
import numpy as np
def pca(X, k):
# 1. 计算协方差矩阵
cov = np.cov(X.T)
# 2. 计算特征值和特征向量
eigenvalues, eigenvectors = np.linalg.eig(cov)
# 3. 选择前k个主成分
sort_index = np.argsort(eigenvalues)[::-1]
topk_eigenvectors = eigenvectors[:,sort_index][:,:k]
# 4. 将数据投影到新的坐标系中
new_X = X.dot(topk_eigenvectors)
return new_X
```
其中,X是一个$n \times d$的矩阵,表示含有n个样本,每个样本是d维向量的数据集;k是要降到的维数。函数返回一个$n \times k$的矩阵,表示降维后的数据集。
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