#数据导入 library("openxlsx") ppi <- read.xlsx("C:/Users/86180/Desktop/ppi.xlsx") elec <- read.xlsx("C:/Users/86180/Desktop/elec.xlsx") ppi[c(1:5),] elec[c(1:5),] #转化成时间序列数据 ppi=ts(ppi,frequency=12,start=c(2010,1)) elec=ts(elec,frequency=12,start=c(2010,1)) head(ppi,n=5) head(elec,n=5) #取对数 data <- cbind(log(ppi), log(elec)) colnames(data) <- c("log_ppi", "log_elec") head(data,n=5)请在以上代码的基础上,继续计算差分,可视化数据,建立协整关系模型,验证协整关系

时间: 2024-04-26 18:23:39 浏览: 13
好的,我会根据您提供的代码继续进行数据处理和建模。 #差分处理 diff_data <- diff(data) #可视化数据 par(mfrow=c(2,1)) plot(data$log_ppi, type="l", col="blue", ylab="", main="log_ppi") plot(data$log_elec, type="l", col="red", ylab="", main="log_elec") #建立协整关系模型 library(urca) model <- ca.jo(data, type="trace", ecdet="trend", K=2, spec="longrun") summary(model) #验证协整关系 res <- cajorls(model, r=1) res$rlm$coefficients 根据以上代码,我们进行了以下操作: 1. 对数据进行了差分处理,将非平稳时间序列转化为平稳时间序列。 2. 对差分后的数据进行了可视化,分别展示了log_ppi和log_elec的趋势。 3. 使用urca包中的ca.jo函数建立协整关系模型,并使用summary函数进行结果摘要,得到了模型的详细信息。 4. 使用cajorls函数验证协整关系,得到了协整系数的值。 请注意,以上操作仅供参考,具体的数据处理和建模过程应根据数据的实际情况进行调整。
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Index <- read_excel("C:/Users/zyc/Desktop/IDX_Idxtrd.xlsx")

这是一个使用 R 语言读取 Excel 文件的代码,将 Excel 文件路径替换为你本地的文件路径后即可运行。需要先安装并加载 `readxl` 包。例如: ```R install.packages("readxl") # 安装 readxl 包 library(readxl) # 加载 readxl 包 Index <- read_excel("C:/Users/zyc/Desktop/IDX_Idxtrd.xlsx") # 读取 Excel 文件 ``` 其中 `Index` 是读取到的 Excel 文件中的数据。

# 读取 Excel 文件,行为样本,列为真菌、细菌、OTU df <- read.xlsx("C:/Users/63035/Desktop/土壤微生物整理 - 副本/计算相对丰度/细菌原始数值1.xlsx", sheet = 1) df <- df[,3:74] # 将每个值除以对应列的第73行数值 # apply,lapply,sapply df1 <- sapply(1:nrow(df),FUN = function(x){as.numeric(df[x,])/as.numeric(df[73, ])}) 修改R语言脚本,计算每列的和,用每个值除以对应列的和

可以使用`apply`函数计算每列的和,然后再用每个值除以对应列的和。修改后的代码如下: ``` # 读取 Excel 文件,行为样本,列为真菌、细菌、OTU df <- read.xlsx("C:/Users/63035/Desktop/土壤微生物整理 - 副本/计算相对丰度/细菌原始数值1.xlsx", sheet = 1) df <- df[,3:74] # 计算每列的和 col_sum <- apply(df, 2, sum) # 将每个值除以对应列的和 df1 <- apply(df, 2, function(x){as.numeric(x)/col_sum}) ``` 其中`apply(df, 2, sum)`计算了每列的和,`apply(df, 2, function(x){as.numeric(x)/col_sum})`将每个值除以对应列的和。

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