java读写.hdf5多数据集,且数据集下面有多个Attributes的例子

时间: 2024-05-02 22:18:11 浏览: 14
下面是一个Java读写.hdf5多数据集,且数据集下面有多个Attributes的例子: ```java import java.nio.file.Files; import java.nio.file.Path; import java.nio.file.Paths; import java.util.Arrays; import ncsa.hdf.hdf5lib.H5; import ncsa.hdf.hdf5lib.exceptions.HDF5Exception; public class HDF5Example { public static void main(String[] args) { String filename = "example.h5"; // Create a new HDF5 file createHDF5File(filename); // Write data to multiple datasets with attributes writeDataToHDF5File(filename); // Read data from multiple datasets with attributes readDataFromHDF5File(filename); } public static void createHDF5File(String filename) { try { // Create a new HDF5 file int file_id = H5.H5Fcreate(filename, H5.H5F_ACC_TRUNC, H5.H5P_DEFAULT, H5.H5P_DEFAULT); H5.H5Fclose(file_id); System.out.println("Created HDF5 file: " + filename); } catch (HDF5Exception e) { System.out.println("Error creating HDF5 file: " + e.getMessage()); } } public static void writeDataToHDF5File(String filename) { try { // Open the HDF5 file for writing int file_id = H5.H5Fopen(filename, H5.H5F_ACC_RDWR, H5.H5P_DEFAULT); // Create a group for the datasets int group_id = H5.H5Gcreate(file_id, "/data", H5.H5P_DEFAULT, H5.H5P_DEFAULT, H5.H5P_DEFAULT); // Write data to the first dataset int[] data1 = {1, 2, 3, 4, 5}; long[] dims1 = {5}; int dataspace_id1 = H5.H5Screate_simple(1, dims1, null); int dataset_id1 = H5.H5Dcreate(group_id, "dataset1", H5.H5T_STD_I32LE, dataspace_id1, H5.H5P_DEFAULT, H5.H5P_DEFAULT, H5.H5P_DEFAULT); H5.H5Dwrite(dataset_id1, H5.H5T_NATIVE_INT, H5.H5S_ALL, H5.H5S_ALL, H5.H5P_DEFAULT, data1); // Add attributes to the first dataset int attribute_id1 = H5.H5Acreate(dataset_id1, "attribute1", H5.H5T_STD_I32LE, dataspace_id1, H5.H5P_DEFAULT, H5.H5P_DEFAULT); int[] attribute_data1 = {1}; H5.H5Awrite(attribute_id1, H5.H5T_NATIVE_INT, attribute_data1); int attribute_id2 = H5.H5Acreate(dataset_id1, "attribute2", H5.H5T_STD_I32LE, dataspace_id1, H5.H5P_DEFAULT, H5.H5P_DEFAULT); int[] attribute_data2 = {2}; H5.H5Awrite(attribute_id2, H5.H5T_NATIVE_INT, attribute_data2); // Close the first dataset H5.H5Aclose(attribute_id1); H5.H5Aclose(attribute_id2); H5.H5Dclose(dataset_id1); // Write data to the second dataset float[] data2 = {1.1f, 2.2f, 3.3f, 4.4f, 5.5f}; long[] dims2 = {5}; int dataspace_id2 = H5.H5Screate_simple(1, dims2, null); int dataset_id2 = H5.H5Dcreate(group_id, "dataset2", H5.H5T_IEEE_F32LE, dataspace_id2, H5.H5P_DEFAULT, H5.H5P_DEFAULT, H5.H5P_DEFAULT); H5.H5Dwrite(dataset_id2, H5.H5T_NATIVE_FLOAT, H5.H5S_ALL, H5.H5S_ALL, H5.H5P_DEFAULT, data2); // Add attributes to the second dataset int attribute_id3 = H5.H5Acreate(dataset_id2, "attribute3", H5.H5T_IEEE_F32LE, dataspace_id2, H5.H5P_DEFAULT, H5.H5P_DEFAULT); float[] attribute_data3 = {1.1f}; H5.H5Awrite(attribute_id3, H5.H5T_NATIVE_FLOAT, attribute_data3); int attribute_id4 = H5.H5Acreate(dataset_id2, "attribute4", H5.H5T_IEEE_F32LE, dataspace_id2, H5.H5P_DEFAULT, H5.H5P_DEFAULT); float[] attribute_data4 = {2.2f}; H5.H5Awrite(attribute_id4, H5.H5T_NATIVE_FLOAT, attribute_data4); // Close the second dataset H5.H5Aclose(attribute_id3); H5.H5Aclose(attribute_id4); H5.H5Dclose(dataset_id2); // Close the group H5.H5Gclose(group_id); // Close the HDF5 file H5.H5Fclose(file_id); System.out.println("Wrote data to HDF5 file: " + filename); } catch (HDF5Exception e) { System.out.println("Error writing data to HDF5 file: " + e.getMessage()); } } public static void readDataFromHDF5File(String filename) { try { // Open the HDF5 file for reading int file_id = H5.H5Fopen(filename, H5.H5F_ACC_RDONLY, H5.H5P_DEFAULT); // Open the group for the datasets int group_id = H5.H5Gopen(file_id, "/data", H5.H5P_DEFAULT); // Read data from the first dataset int dataset_id1 = H5.H5Dopen(group_id, "dataset1", H5.H5P_DEFAULT); int dataspace_id1 = H5.H5Dget_space(dataset_id1); long[] dims1 = new long[1]; H5.H5Sget_simple_extent_dims(dataspace_id1, dims1, null); int[] data1 = new int[(int)dims1[0]]; H5.H5Dread(dataset_id1, H5.H5T_NATIVE_INT, H5.H5S_ALL, H5.H5S_ALL, H5.H5P_DEFAULT, data1); // Read attributes from the first dataset int attribute_id1 = H5.H5Aopen(dataset_id1, "attribute1", H5.H5P_DEFAULT); int[] attribute_data1 = new int[1]; H5.H5Aread(attribute_id1, H5.H5T_NATIVE_INT, attribute_data1); int attribute_id2 = H5.H5Aopen(dataset_id1, "attribute2", H5.H5P_DEFAULT); int[] attribute_data2 = new int[1]; H5.H5Aread(attribute_id2, H5.H5T_NATIVE_INT, attribute_data2); // Close the first dataset and attributes H5.H5Aclose(attribute_id1); H5.H5Aclose(attribute_id2); H5.H5Dclose(dataset_id1); // Print the first dataset and attributes System.out.println("Data from dataset1: " + Arrays.toString(data1)); System.out.println("Attribute1 from dataset1: " + attribute_data1[0]); System.out.println("Attribute2 from dataset1: " + attribute_data2[0]); // Read data from the second dataset int dataset_id2 = H5.H5Dopen(group_id, "dataset2", H5.H5P_DEFAULT); int dataspace_id2 = H5.H5Dget_space(dataset_id2); long[] dims2 = new long[1]; H5.H5Sget_simple_extent_dims(dataspace_id2, dims2, null); float[] data2 = new float[(int)dims2[0]]; H5.H5Dread(dataset_id2, H5.H5T_NATIVE_FLOAT, H5.H5S_ALL, H5.H5S_ALL, H5.H5P_DEFAULT, data2); // Read attributes from the second dataset int attribute_id3 = H5.H5Aopen(dataset_id2, "attribute3", H5.H5P_DEFAULT); float[] attribute_data3 = new float[1]; H5.H5Aread(attribute_id3, H5.H5T_NATIVE_FLOAT, attribute_data3); int attribute_id4 = H5.H5Aopen(dataset_id2, "attribute4", H5.H5P_DEFAULT); float[] attribute_data4 = new float[1]; H5.H5Aread(attribute_id4, H5.H5T_NATIVE_FLOAT, attribute_data4); // Close the second dataset and attributes H5.H5Aclose(attribute_id3); H5.H5Aclose(attribute_id4); H5.H5Dclose(dataset_id2); // Print the second dataset and attributes System.out.println("Data from dataset2: " + Arrays.toString(data2)); System.out.println("Attribute3 from dataset2: " + attribute_data3[0]); System.out.println("Attribute4 from dataset2: " + attribute_data4[0]); // Close the group H5.H5Gclose(group_id); // Close the HDF5 file H5.H5Fclose(file_id); System.out.println("Read data from HDF5 file: " + filename); } catch (HDF5Exception e) { System.out.println("Error reading data from HDF5 file: " + e.getMessage()); } } } ``` 这个例子创建了一个名为“example.h5”的新HDF5文件,然后向其中写入两个数据集“dataset1”和“dataset2”,每个数据集下都有两个属性。然后,它从文件中读取数据集和属性,并将它们打印到控制台上。

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