kdtree在多维数据中寻找近邻数据的Python代码
时间: 2024-02-18 13:05:22 浏览: 98
kdtree搜索近邻
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下面是一个使用Python实现的kdtree多维数据寻找近邻数据的示例代码:
```python
import numpy as np
class Node:
def __init__(self, data, left=None, right=None):
self.data = data
self.left = left
self.right = right
class KDTree:
def __init__(self, data):
self.k = data.shape[1]
self.root = self.build_kdtree(data)
def build_kdtree(self, data, depth=0):
n = data.shape[0]
if n <= 0:
return None
axis = depth % self.k
sorted_data = data[data[:, axis].argsort()]
mid = n // 2
return Node(
sorted_data[mid],
self.build_kdtree(sorted_data[:mid], depth+1),
self.build_kdtree(sorted_data[mid+1:], depth+1)
)
def find_nearest_neighbor(self, point):
best_node = None
best_dist = np.inf
def search(node, depth=0):
nonlocal best_node, best_dist
if node is None:
return
axis = depth % self.k
if point[axis] < node.data[axis]:
search(node.left, depth+1)
else:
search(node.right, depth+1)
dist = np.linalg.norm(point - node.data)
if dist < best_dist:
best_node = node
best_dist = dist
if abs(point[axis] - node.data[axis]) < best_dist:
if point[axis] < node.data[axis]:
search(node.right, depth+1)
else:
search(node.left, depth+1)
search(self.root)
return best_node.data
```
这个示例代码中,我们首先定义了一个Node类来表示kdtree的节点,然后定义了一个KDTree类来表示kdtree。在KDTree类中,我们实现了kdtree的构建方法build_kdtree和寻找最近邻的方法find_nearest_neighbor。构建方法中,我们首先按照节点的维度进行排序,然后递归地构建左右子树。在寻找最近邻的方法中,我们从根节点开始递归遍历kdtree,并计算当前节点与目标点的距离。如果当前节点的距离小于已知的最短距离,则将当前节点作为当前最近邻,并更新最短距离的值。然后依次遍历左右子树,直到找到距离目标点最近的数据点为止。
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