文件一的格式内容如下: MADS-MIKC TF MADS-M-type TF MYB-related TF MYB TF NAC TF NF-X1 TF NF-YA TF NF-YB TF NF-YC TF OFP TF PLATZ TF RWP-RK TF S1Fa-like TF SAP TF SBP TF SRS TF STAT TF TCP TF Tify TF Trihelix TF ... ... 文件二的格式内容如下: Chr19.g21850.m1_D13 AP2/ERF-AP2 TF AP2/ERF->AP2/ERF-AP2 Chr19.g21885.m1_D13 GARP-ARR-B TF GARP->GARP-ARR-B Chr19.g21892.m1_D13 bHLH TF bHLH Chr19.g21896.m1_D13 WRKY TF WRKY Chr19.g21913.m1_D13 AP2/ERF-ERF TF AP2/ERF->AP2/ERF-ERF Chr19.g21920.m1_D13 HB-BELL TF HB->HB-BELL Chr19.g21926.m1_D13 AUX/IAA TR AUX/IAA Chr19.g21934.m1_D13 bZIP TF bZIP Chr19.g21951.m1_D13 HB-PHD TF HB->HB-PHD Chr19.g21959.m1_D13 C2H2 TF C2H2 Chr19.g21967.m3_D13 FAR1 TF FAR1 Chr19.g21968.m1_D13 AP2/ERF-ERF TF AP2/ERF->AP2/ERF-ERF Chr19.g21970.m1_D13 Jumonji TR Jumonji Chr19.g21987.m1_D13 TCP TF TCP Chr19.g21994.m1_D13 bHLH TF bHLH Chr19.g21996.m1_D13 FAR1 TF FAR1 Chr19.g22000.m1_D13 B3-ARF TF B3->B3-ARF Chr19.g22009.m1_D13 RB TR RB Chr19.g22031.m1_D13 LOB TF LOB ... ... 写一段代码根据文件一的内容在文件二的第二、第三列去匹配,并统计出文件一内容每行出现的频次并打印
时间: 2024-03-27 19:40:34 浏览: 158
大豆MADS-box基因GmSHPa的克隆与表达分析
以下是Python代码实现:
```python
# 读取文件一
with open('file1.txt', 'r') as f:
file1 = f.read().split()
# 读取文件二
with open('file2.txt', 'r') as f:
file2 = f.read().split('\n')
# 统计频次的字典
freq_dict = {tf: 0 for tf in file1}
# 匹配文件一和文件二
for line in file2:
if not line.strip(): # 排除空行
continue
_, tf, _ = line.split('\t')
if tf in freq_dict:
freq_dict[tf] += 1
# 打印结果
for tf, freq in freq_dict.items():
print(f'{tf}\t{freq}')
```
代码思路:
首先读取文件一和文件二的内容,分别存储为列表 `file1` 和字符串 `file2`。然后定义一个字典 `freq_dict`,用于存储每个 TF 在文件二出现的频次。接下来遍历文件二的每一行,如果第二列的 TF 出现在文件一中,则将对应的频次加一。最后遍历 `freq_dict`,打印每个 TF 出现的频次。
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