adj_matrix = graph.adjacency_matrix().to_dense()报错:FileNotFoundError: Cannot find DGL C++ sparse library at D:\code\myworld\lib\site-packages\dgl\dgl_sparse\dgl_sparse_pytorch_2.0.1.dll
时间: 2023-09-30 19:06:18 浏览: 339
这个错误通常是由于 DGL C++ sparse 库没有正确安装或者版本不匹配导致的。建议您检查以下几个方面:
1. 检查您的环境是否已经安装了 DGL C++ sparse 库,并且版本是否匹配。
2. 如果您是通过 pip 安装的 DGL,请考虑重新安装该库,可能会解决问题。
3. 如果您是从源代码编译安装 DGL,请确保您已经正确编译了 C++ sparse 库,并且将其正确链接到 Python 库中。
如果您仍然无法解决问题,请提供更多详细信息,例如您的操作系统、Python 版本、DGL 版本等,以便我们更好地帮助您解决问题。
相关问题
dgl 加载bin文件,获得邻接矩阵,不允许使用adj_matrix = graph.adjacency_matrix().to_dense()
如果您不想使用`adj_matrix = graph.adjacency_matrix().to_dense()`来获得邻接矩阵,可以使用以下方法:
方法一:使用`dgl.to_scipy`将邻接矩阵转换为稀疏矩阵,然后使用`toarray()`方法将稀疏矩阵转换为稠密矩阵:
```python
import dgl
import numpy as np
with open('graph.bin', 'rb') as f:
graph_data = np.load(f, allow_pickle=True)
graph = dgl.graph((graph_data['edge_index'][0], graph_data['edge_index'][1]))
adj_matrix = dgl.to_scipy(graph.adjacency_matrix())
dense_matrix = adj_matrix.toarray()
```
方法二:使用`dgl.backend.numpy()`将邻接矩阵转换为numpy数组,然后使用`numpy.ndarray`的`tolist()`方法将numpy数组转换为Python列表:
```python
import dgl
import numpy as np
with open('graph.bin', 'rb') as f:
graph_data = np.load(f, allow_pickle=True)
graph = dgl.graph((graph_data['edge_index'][0], graph_data['edge_index'][1]))
adj_matrix = graph.adjacency_matrix()
dense_matrix = dgl.backend.numpy()((adj_matrix != 0).astype(np.int32)).tolist()
```
需要注意的是,这两种方法都会将邻接矩阵转换为稠密矩阵,如果邻接矩阵过大,可能会导致内存溢出或性能问题。如果需要处理大规模的邻接矩阵,建议使用稀疏矩阵进行计算。
dgl 加载bin文件,获得邻接矩阵,不允许使用adj_matrix = graph.adjacency_matrix()
如果您不想使用`adj_matrix = graph.adjacency_matrix()`来获得邻接矩阵,可以使用以下方法:
方法一:使用`dgl.to_networkx`将dgl图对象转换为NetworkX图对象,然后使用NetworkX提供的方法获得邻接矩阵:
```python
import dgl
import networkx as nx
import numpy as np
with open('graph.bin', 'rb') as f:
graph_data = np.load(f, allow_pickle=True)
graph = dgl.graph((graph_data['edge_index'][0], graph_data['edge_index'][1]))
nx_graph = dgl.to_networkx(graph)
adj_matrix = nx.adjacency_matrix(nx_graph)
```
方法二:使用`dgl.to_scipy`将邻接矩阵转换为稀疏矩阵,然后使用`toarray()`方法将稀疏矩阵转换为稠密矩阵:
```python
import dgl
import numpy as np
with open('graph.bin', 'rb') as f:
graph_data = np.load(f, allow_pickle=True)
graph = dgl.graph((graph_data['edge_index'][0], graph_data['edge_index'][1]))
adj_matrix = dgl.to_scipy(graph.adjacency_matrix())
dense_matrix = adj_matrix.toarray()
```
需要注意的是,这两种方法都会将邻接矩阵转换为稠密矩阵,如果邻接矩阵过大,可能会导致内存溢出或性能问题。如果需要处理大规模的邻接矩阵,建议使用稀疏矩阵进行计算。
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