如何读取MHD ZRAW的数据集

MHD和ZRAW是一种常见的医学图像数据格式。MHD文件是元数据文件，包含有关数据集的信息，例如数据的大小，数据类型和数据的维度。ZRAW文件是原始数据文件，包含数据集的实际像素值。

读取MHD ZRAW数据集的步骤如下：

1. 首先，您需要使用Python中的SimpleITK库来读取MHD文件。您可以使用以下代码来读取MHD文件：

   import SimpleITK as sitk
   image = sitk.ReadImage('example.mhd')

这将读取名为“example.mhd”的文件，并将其存储在名为“image”的变量中。

2. 接下来，您可以使用以下代码来读取相应的ZRAW文件：

   import numpy as np
   zraw = np.fromfile('example.zraw', dtype=np.short)

这将读取名为“example.zraw”的文件，并将其存储在名为“zraw”的变量中。

3. 现在，您需要将zraw数组重塑为与MHD文件中指定的形状相同的形状。您可以使用以下代码来执行此操作：

   size = list(image.GetSize())
   size.reverse()
   zraw = np.reshape(zraw, size, order='F')

这将根据MHD文件中指定的形状重新塑造zraw数组，并将其存储在zraw变量中。

4. 最后，您可以将MHD文件中存储的元数据与zraw数组组合起来，以便进行后续处理。您可以使用以下代码来完成此操作：

   data = {'image': zraw, 'spacing': image.GetSpacing(), 'origin': image.GetOrigin()}

这将创建一个名为“数据”的字典，其中包含zraw数组以及MHD文件中指定的间距和原点。

请注意，上述代码仅适用于使用医学图像数据格式的数据集。如果您使用不同的数据格式，您需要使用相应的库和代码来读取数据。