self.atom_featurizer = CanonicalAtomFeaturizer() self.bond_featurizer = CanonicalBondFeaturizer(self_loop=True)这两句的作用
时间: 2023-05-10 11:55:39 浏览: 47
这两句代码的作用是创建了两个特征提取器,一个用于原子特征,一个用于键特征。其中,CanonicalAtomFeaturizer()用于提取原子的特征,CanonicalBondFeaturizer(self_loop=True)用于提取键的特征,self_loop=True表示包括自环键。
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class DTIDataset(data.Dataset): def __init__(self, list_IDs, df, max_drug_nodes=290): self.list_IDs = list_IDs self.df = df self.max_drug_nodes = max_drug_nodes self.atom_featurizer = CanonicalAtomFeaturizer() self.bond_featurizer = CanonicalBondFeaturizer(self_loop=True) self.fc = partial(smiles_to_bigraph, add_self_loop=True)是什么意思
这段代码定义了一个名为DTIDataset的类,它继承自data.Dataset。在初始化函数中,它接受三个参数:list_IDs、df和max_drug_nodes。它还定义了一个atom_featurizer和一个bond_featurizer,它们分别使用CanonicalAtomFeaturizer和CanonicalBondFeaturizer类进行初始化。最后,它定义了一个fc函数,它使用smiles_to_bigraph函数将SMILES字符串转换为图形表示,并添加了自环。
FROM bobm, bordt, bopdt, bocpd WHERE bobm.bond_code=bordt.bond_code(+) AND bobm.bond_code =bopdt.bond_code(+) AND bobm.bond_code =bocpd.bond_code(+);
这是一个 SQL 查询语句,它使用了表之间的连接操作符(+)来表示左外连接。这个查询从四个表中获取数据:bobm、bordt、bopdt和bocpd。它使用了bobm表中的bond_code列来连接这些表。
左外连接表示将左边的表(bobm)中的所有行都包括在结果中,而右边的表(bordt, bopdt, bocpd)中只包括与左边表中的行匹配的行。如果没有匹配的行,则右边的表中的列将包含NULL值。
请注意,我的回答是基于对您提供的SQL查询的理解,如果有任何误解或遗漏,请及时纠正。