plt.scatter(data.iloc[:, 2], data.iloc[:, 1], c=kmeans_labels)

时间: 2024-01-15 11:04:12 浏览: 146
这是一个使用matplotlib库中scatter函数进行散点图绘制的代码片段。其中,"data"是一个pandas DataFrame,".iloc[:, 2]"选取了所有行的第三列作为x轴数据,".iloc[:, 1]"选取了所有行的第二列作为y轴数据,"c=kmeans_labels"表示将k-means聚类算法的标签作为颜色参数来区分不同的数据点。
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import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.preprocessing import StandardScaler from sklearn.decomposition import PCA from sklearn.cluster import KMeans from scipy.spatial import Voronoi, voronoi_plot_2d # 生成示例数据 data = df.iloc[:,1:15] # 标准化处理 scaler = StandardScaler() data_scaled = scaler.fit_transform(data) # 主成分分析 pca = PCA(n_components=5) data_pca = pca.fit_transform(data_scaled) # 聚类分析 kmeans = KMeans(n_clusters=3) kmeans.fit(data_pca) labels = kmeans.labels_ centers = kmeans.cluster_centers_ # 绘制Voronoi图 vor = Voronoi(centers) voronoi_plot_2d(vor) # 绘制样本点 plt.scatter(data_pca[:, 0], data_pca[:, 1], c=labels) # 设置坐标轴标签和标题 plt.xlabel('PC1') plt.ylabel('PC2') plt.title('Voronoi Diagram') # 显示图形 plt.show()

您的代码看起来几乎是正确的,但有一点需要注意。Voronoi图是在原始数据空间中绘制的,而不是在主成分空间中。因此,在绘制Voronoi图之前,我们需要将主成分投影回原始数据空间。以下是修改后的代码: ```python import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.preprocessing import StandardScaler from sklearn.decomposition import PCA from sklearn.cluster import KMeans from scipy.spatial import Voronoi, voronoi_plot_2d # 生成示例数据 data = df.iloc[:, 1:15] # 标准化处理 scaler = StandardScaler() data_scaled = scaler.fit_transform(data) # 主成分分析 pca = PCA(n_components=5) data_pca = pca.fit_transform(data_scaled) # 聚类分析 kmeans = KMeans(n_clusters=3) kmeans.fit(data_pca) labels = kmeans.labels_ centers = kmeans.cluster_centers_ # 将主成分投影回原始数据空间 data_projected = pca.inverse_transform(data_pca) # 绘制Voronoi图 vor = Voronoi(centers) voronoi_plot_2d(vor) # 绘制样本点 plt.scatter(data_projected[:, 0], data_projected[:, 1], c=labels) # 设置坐标轴标签和标题 plt.xlabel('Feature 1') plt.ylabel('Feature 2') plt.title('Voronoi Diagram') # 显示图形 plt.show() ``` 请确保在代码中替换`df.iloc[:, 1:15]`为您实际的数据。这段代码将绘制投影回原始数据空间后的样本点,并在Voronoi图上显示聚类结果。

逐句注释import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.cluster import KMeans from sklearn.metrics import silhouette_score import pandas as pd data = pd.read_csv('xigua.csv') # 加载数据 print(data) print(data.shape) X = data.iloc[: ,1:3].values print(X) print(X.shape) plt.scatter(X[:, 0], X[:, 1], c = "red", marker = 'o', label = 'None') plt.ylabel('Sugar content') plt.xlabel('density') plt.legend(loc = 2) plt.show() #运用数学方法计算k的取值 score = [] for i in range(10): model = KMeans(n_clusters = i + 2) model.fit(X[:, 1:3]) #计算轮廓系数,系数取值范围[-1,1],越接近1的,k的值越好 score.append(silhouette_score(X[:, 0:2], model.labels_, metric = 'euclidean')) plt.figure(figsize = (5, 4)) plt.plot(range(2, 12, 1), score) plt.show() #n_clusters表示k的取值,也就是聚成簇的数量 #fit()函数:做的就是模型训练 kmeans = KMeans(n_clusters = 3, random_state = 0, ).fit(X[:, 1:3]) label_pred = kmeans.labels_#获取聚类标签 print(label_pred) centroids = kmeans.cluster_centers_ #获取聚类簇心 print(centroids) #绘制结果 x0 = X[label_pred == 0] x1 = X[label_pred == 1] plt.scatter(x0[:, 0], x0[:, 1], c = "red", marker = 'o', label = 'label0') plt.scatter(x1[:, 0], x1[:, 1], c = "green", marker = '*', label = 'label1') plt.ylabel('Sugar content') plt.xlabel('density') plt.legend(loc = 2) plt.show()

这份代码主要是对西瓜数据集进行聚类分析,下面是逐行的注释: ``` import matplotlib.pyplot as plt # 导入绘图库 from sklearn.cluster import KMeans # 导入kmeans聚类算法 from sklearn.metrics import silhouette_score # 导入轮廓系数评价指标 import pandas as pd # 导入数据处理库 data = pd.read_csv('xigua.csv') # 加载数据 print(data) # 打印数据 print(data.shape) # 打印数据的形状 X = data.iloc[:, 1:3].values # 取第2列和第3列作为特征 print(X) # 打印特征 print(X.shape) # 打印特征的形状 plt.scatter(X[:, 0], X[:, 1], c="red", marker='o', label='None') # 绘制散点图 plt.ylabel('Sugar content') # y轴标签 plt.xlabel('density') # x轴标签 plt.legend(loc=2) # 图例位置 plt.show() # 显示图像 score = [] # 初始化轮廓系数列表 for i in range(10): # 循环计算轮廓系数 model = KMeans(n_clusters=i + 2) # 聚类模型 model.fit(X[:, 1:3]) # 训练模型 # 计算轮廓系数,系数取值范围[-1,1],越接近1的,k的值越好 score.append(silhouette_score(X[:, 0:2], model.labels_, metric='euclidean')) plt.figure(figsize=(5, 4)) # 创建图像 plt.plot(range(2, 12, 1), score) # 绘制轮廓系数图像 plt.show() # 显示图像 kmeans = KMeans(n_clusters=3, random_state=0).fit(X[:, 1:3]) # 聚类模型 label_pred = kmeans.labels_ # 获取聚类标签 print(label_pred) # 打印聚类标签 centroids = kmeans.cluster_centers_ # 获取聚类簇心 print(centroids) # 打印聚类簇心 x0 = X[label_pred == 0] # 获取第一类样本 x1 = X[label_pred == 1] # 获取第二类样本 plt.scatter(x0[:, 0], x0[:, 1], c="red", marker='o', label='label0') # 绘制第一类样本的散点图 plt.scatter(x1[:, 0], x1[:, 1], c="green", marker='*', label='label1') # 绘制第二类样本的散点图 plt.ylabel('Sugar content') # y轴标签 plt.xlabel('density') # x轴标签 plt.legend(loc=2) # 图例位置 plt.show() # 显示图像 ``` 这段代码的目的是对西瓜数据集进行聚类分析,首先通过读取数据集获取特征,然后绘制散点图观察数据的分布情况,接着通过计算轮廓系数来确定最优的聚类簇数,再利用KMeans算法进行聚类分析,并绘制聚类结果的散点图。
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在下面代码中添加一个可视化图,用来画出r经过t_sne之后前15行数据的图 import pandas as pd from sklearn import cluster from sklearn import metrics import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.manifold import TSNE from sklearn.decomposition import PCA def k_means(data_set, output_file, png_file, png_file1, t_labels, score_file, set_name): model = cluster.KMeans(n_clusters=7, max_iter=1000, init="k-means++") model.fit(data_set) # print(list(model.labels_)) p_labels = list(model.labels_) r = pd.concat([data_set, pd.Series(model.labels_, index=data_set.index)], axis=1) r.columns = list(data_set.columns) + [u'聚类类别'] print(r) # r.to_excel(output_file) with open(score_file, "a") as sf: sf.write("By k-means, the f-m_score of " + set_name + " is: " + str(metrics.fowlkes_mallows_score(t_labels, p_labels))+"\n") sf.write("By k-means, the rand_score of " + set_name + " is: " + str(metrics.adjusted_rand_score(t_labels, p_labels))+"\n") '''pca = PCA(n_components=2) pca.fit(data_set) pca_result = pca.transform(data_set) t_sne = pd.DataFrame(pca_result, index=data_set.index)''' t_sne = TSNE() t_sne.fit(data_set) t_sne = pd.DataFrame(t_sne.embedding_, index=data_set.index) plt.rcParams['font.sans-serif'] = ['SimHei'] plt.rcParams['axes.unicode_minus'] = False dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 0] plt.plot(dd[0], dd[1], 'r.') dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 1] plt.plot(dd[0], dd[1], 'go') dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 2] plt.plot(dd[0], dd[1], 'b*') dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 3] plt.plot(dd[0], dd[1], 'o') dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 4] plt.plot(dd[0], dd[1], 'm.') dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 5] plt.plot(dd[0], dd[1], 'co') dd = t_sne[r[u'聚类类别'] == 6] plt.plot(dd[0], dd[1], 'y*') plt.savefig(png_file) '''plt.scatter(data_set.iloc[:, 0], data_set.iloc[:, 1], c=model.labels_) plt.savefig(png_file) plt.clf()''' frog_data = pd.read_csv("D:/PyCharmPython/pythonProject/mfcc3.csv") tLabel = [] for family in frog_data['name']: if family == "A": tLabel.append(0) elif family == "B": tLabel.append(1) elif family == "C": tLabel.append(2) elif family == "D": tLabel.append(3) elif family == "E": tLabel.append(4) elif family == "F": tLabel.append(5) elif family == "G": tLabel.append(6) scoreFile = "D:/PyCharmPython/pythonProject/scoreOfClustering.txt" first_set = frog_data.iloc[:, 1:1327] k_means(first_set, "D:/PyCharmPython/pythonProject/kMeansSet_1.xlsx", "D:/PyCharmPython/pythonProject/kMeansSet_2.png", "D:/PyCharmPython/pythonProject/kMeansSet_2_1.png", tLabel, scoreFile, "Set_1")

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