分析shell脚本while IFS=',' read col1 col2 col3 col4 col5 col6 col7 do mkdir -p $col7 cp $col6 $col7 done < resultSum.csv

时间: 2023-10-02 20:03:50 浏览: 54
这个脚本的作用是读取名为resultSum.csv的文件,使用逗号作为分隔符,每次读取一行,将该行的第6列拷贝到第7列指定的目录下。如果目录不存在,则先创建目录。 具体解释: - while IFS=',' read col1 col2 col3 col4 col5 col6 col7:使用while循环读取resultSum.csv文件中的每一行,并将行中逗号分隔的7个字段分别赋值给7个变量col1、col2、col3、col4、col5、col6、col7。IFS=','表示使用逗号作为分隔符。 - mkdir -p $col7:如果目录$col7不存在,则创建目录$col7。-p选项表示如果目录已存在,则不会报错,也不会覆盖目录。 - cp $col6 $col7:将$col6指定的文件拷贝到$col7指定的目录下。 最后,使用<符号将resultSum.csv文件作为输入流传递给while循环。循环会逐行读取文件内容,并执行对应的操作。
相关问题

对以下脚本进行优化while IFS=',' read col1 col2 col3 col4 col5 col6 col7 do mkdir -p $col7 cp $col6 $col7 done < resultSum.csv

对于这个脚本,可以考虑以下的优化方案: 1. 使用 awk 命令代替 while 循环 awk 命令能够更快地读取文件内容,因此可以用来替代 while 循环。以下是使用 awk 命令的优化方案: ```bash awk -F"," '{system("mkdir -p "$7" && cp "$6" "$7)}' resultSum.csv ``` 2. 使用 xargs 命令代替 while 循环 xargs 命令能够将输入转换为参数,并且能够并行执行命令。可以使用 xargs 命令来并行执行 mkdir 和 cp 命令。以下是使用 xargs 命令的优化方案: ```bash cat resultSum.csv | xargs -I {} -P 8 bash -c 'mkdir -p $(echo {} | cut -d "," -f 7) && cp $(echo {} | cut -d "," -f 6) $(echo {} | cut -d "," -f 7)' ``` 其中 -P 8 参数指定了使用 8 个进程进行并行处理。 3. 使用 rsync 命令代替 cp 命令 rsync 命令能够实现增量复制,并且具有更好的性能。可以使用 rsync 命令来代替 cp 命令。以下是使用 rsync 命令的优化方案: ```bash awk -F"," '{system("mkdir -p "$7" && rsync -av "$6" "$7)}' resultSum.csv ``` 以上都是对原脚本的优化方案,你可以根据具体情况选择其中一种或多种方案进行优化。

IFS=: read -r user _ _ _ _ home shell;

这行代码用于从 `/etc/passwd` 文件中读取一行用户信息,并将其分割成多个字段。其中 `IFS` 变量定义了字段的分隔符,这里将其设置为冒号 `:`,因为 `/etc/passwd` 文件中的每一行都是由冒号分隔的字段组成。 接着,`read` 命令将从标准输入流中读取一行用户信息,并将其分割成多个字段,这些字段分别存储在 `user`、`_`、`_`、`_`、`_`、`home` 和 `shell` 变量中。其中,`_` 表示一个占位符,表示我们不需要这个字段,因为在 `/etc/passwd` 文件中,第二个字段是密码哈希值,我们不需要使用它。 因此,这行代码实际上是在获取用户的用户名、主目录和登录 shell 信息,其他字段都被忽略了。

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#!/bin/bash csv_file="/Analysis_B/20220326_JNILI/014_seqtk/004_rename_csv/AAAAA_rename.csv" folder_path="/Analysis_B/20220326_JNILI/014_seqtk/003_subseq_split/AAAAA/" while IFS=',' read -r col1 col2 col3 col4 col5 col6 col7 col8 col9 col10 col11 col12 col13 col14 col15 col16 col17 col18 col19 col20 col21 col22 col23 col24 col25 col26 col27 col28 col29 col30 col31 col32 col33 col34 col35 col36 col37 col38 col39 col40 col41 col42 col43 col44 col45 col46 col47 col48 col49 col50; do file_name="$col5.fa" if [ -f "$folder_path/$file_name" ]; then new_name="$col4::$col5::$col25::$col17::$col26::$col10.fa" mv "$folder_path/$file_name" "$folder_path/$new_name" fi done < "$csv_file" 在python中,将这段脚本的AAAAA替换成特定值,AAAAA有95个,分别为JN_1901 JN_1902 JN_1905 JN_1906 JN_1907 JN_1910 JN_1915 JN_1919 JN_1926 JN_1927 JN_1930 JN_1932 JN_1933 JN_1936 JN_1937 JN_1941 JN_1942 JN_1944 JN_1945 JN_1946 JN_1948 JN_1949 JN_1950 JN_1952 JN_1953 JN_1954 JN_1955 JN_1958 JN_1959 JN_1961 JN_1966 JN_1967 JN_1969 JN_1970 JN_1973 JN_1974 JN_1975 JN_1977 JN_1978 JN_1979 JN_1981 JN_1986 JN_1987 JN_1988 JN_1990 JN_1993 JN_1996 JN_2002 JN_2004 JN_2005 JN_2010 JN_2011 JN_2014 JN_2016 JN_2017 JN_2018 JN_2023 JN_2025 JN_2027 JN_2030 JN_2043 JN_2045 JN_2046 JN_2049 JN_2050 JN_2051 JN_2053 JN_2054 JN_2055 JN_2057 JN_2058 JN_2060 JN_2061 JN_2062 JN_2063 JN_2064 JN_2065 JN_2066 JN_2067 JN_2068 JN_2069 JN_2070 JN_2071 JN_2072 JN_2074 JN_2076 JN_2078 JN_2079 JN_2083 JN_2084 JN_2086 JN_2087 JN_2090 JN_2091 JN_2093,帮我写一个代码

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