在Linux的Slurm服务器中,使用sjob.sh文件分贝资源运行python程序,如果我有两个python程序要按照先后的顺序去执行,在sjob.sh文件中,我应该如何去编写?
时间: 2023-12-14 07:36:47 浏览: 87
您可以使用Slurm Job Dependencies来实现这一点,具体步骤如下:
1. 在sjob.sh文件中,按照顺序提交两个Python程序的作业。例如:
```
#!/bin/bash
# Submit first Python job
sbatch job1.sh
# Submit second Python job
sbatch job2.sh
```
2. 在第二个Python作业(job2.sh)中添加依赖于第一个Python作业(job1.sh)的语句。例如:
```
#!/bin/bash
# Submit second Python job with a dependency on the first job
sbatch --dependency=afterok:$(cat job1.sh | tail -n 1 | awk '{print $4}') job2.sh
# Run Python script
python script2.py
```
在这里,我们使用了`--dependency=afterok:$(cat job1.sh | tail -n 1 | awk '{print $4}')`来指定依赖于第一个作业的成功完成。`$(cat job1.sh | tail -n 1 | awk '{print $4}')`用于获取第一个作业的Job ID。
注意:在使用Job Dependencies时,必须使用`sbatch`命令来提交作业,而不是`srun`命令。
希望这对您有所帮助!
相关问题
在Slurm中,输入这个指令意味着什么:sbatch sjob.sh
这个指令的意思是使用Slurm提交一个作业,并将作业脚本文件命名为sjob.sh。Slurm是一个开源的作业调度系统,用于管理大型计算集群中的作业。sbatch是Slurm中用于提交作业的命令,它接受一个作业脚本文件作为参数,作业脚本文件中包含了作业的详细信息,如任务数、节点数、运行时间等。通过执行sbatch sjob.sh,Slurm会根据作业脚本文件的设置,将作业提交到计算集群上执行。
在Slurm中,如果我使用shell程序去运行一个python程序,但这个python程序我本身就需要设置一些运行参数,如“--epoch 15”等,并且我还希望将这个python程序的输出重定向到一个名为output.txt的文件中,这段shell程序我该怎么写?
你可以使用以下的shell程序来运行你的python程序,并将输出重定向到`output.txt`文件中:
```bash
#!/bin/bash
#SBATCH --job-name=myjob
#SBATCH --output=output.txt
# 加载Python模块
module load python
# 运行Python程序并传递参数
python your_program.py --epoch 15 > output.txt
```
在上面的shell程序中,`#SBATCH`开头的行是Slurm的参数设置,包括作业名称和输出文件名。`module load python`是加载Python模块的命令,确保在执行Python程序之前已经安装了Python环境。`python your_program.py --epoch 15 > output.txt`是运行Python程序并传递参数的命令,并将输出重定向到`output.txt`文件中。在这个命令中,`--epoch 15`是你要传递的参数,`>`代表将输出重定向到文件中。
注意,这个命令会覆盖掉`output.txt`文件中的内容,如果你希望每次运行程序时都将输出添加到文件末尾,可以使用`>>`代替`>`。
阅读全文