在Linux的Slurm服务器中,使用sjob.sh文件分贝资源运行python程序,如果我有两个python程序要按照先后的顺序去执行,在sjob.sh文件中,我应该如何去编写?
时间: 2023-12-14 22:36:47 浏览: 33
您可以使用Slurm Job Dependencies来实现这一点,具体步骤如下:
1. 在sjob.sh文件中,按照顺序提交两个Python程序的作业。例如:
```
#!/bin/bash
# Submit first Python job
sbatch job1.sh
# Submit second Python job
sbatch job2.sh
```
2. 在第二个Python作业(job2.sh)中添加依赖于第一个Python作业(job1.sh)的语句。例如:
```
#!/bin/bash
# Submit second Python job with a dependency on the first job
sbatch --dependency=afterok:$(cat job1.sh | tail -n 1 | awk '{print $4}') job2.sh
# Run Python script
python script2.py
```
在这里,我们使用了`--dependency=afterok:$(cat job1.sh | tail -n 1 | awk '{print $4}')`来指定依赖于第一个作业的成功完成。`$(cat job1.sh | tail -n 1 | awk '{print $4}')`用于获取第一个作业的Job ID。
注意:在使用Job Dependencies时,必须使用`sbatch`命令来提交作业,而不是`srun`命令。
希望这对您有所帮助!
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```
#!/bin/bash
#SBATCH --job-name=myjob
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python=/path/to/python
$python myscript.py
```
其中,/path/to/python是python的安装路径,myscript.py是要运行的python脚本名称。这样就可以正确运行python程序了。
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```
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```
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```
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#SBATCH --job-name=myjob
#SBATCH --output=output.txt
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python myscript.py
```
其中,/path/to/conda是conda的安装路径,/path/to/new_env是新conda环境的路径,myscript.py是要运行的python脚本名称。这样就可以正确激活新的conda环境并运行python程序了。
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```
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```
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