用python实现一个聚类(angens )算法实例

时间: 2023-07-12 11:13:57 浏览: 51
好的,以下是使用Python实现Agnes聚类算法的示例代码: ```python import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt class Agnes: def __init__(self, n_clusters=2): self.n_clusters = n_clusters def fit(self, X): n_samples = X.shape[0] self.labels_ = np.zeros(n_samples, dtype=np.int) # 计算距离矩阵 distances = np.zeros((n_samples, n_samples)) for i in range(n_samples): for j in range(i+1, n_samples): distances[i,j] = np.sqrt(np.sum((X[i]-X[j])**2)) distances[j,i] = distances[i,j] # 初始化聚类簇 clusters = [] for i in range(n_samples): clusters.append([i]) # 合并聚类簇 while len(clusters) > self.n_clusters: min_distance = np.inf for i in range(len(clusters)): for j in range(i+1, len(clusters)): for k in range(len(clusters[i])): for l in range(len(clusters[j])): distance = distances[clusters[i][k], clusters[j][l]] if distance < min_distance: min_distance = distance merge_clusters = (i, j) clusters[merge_clusters[0]] += clusters[merge_clusters[1]] del clusters[merge_clusters[1]] # 计算聚类标签 for i, cluster in enumerate(clusters): for j in cluster: self.labels_[j] = i return self.labels_ ``` 接下来,我们可以使用该算法对样本进行聚类,并可视化结果: ```python from sklearn.datasets import make_blobs # 生成样本数据 X, y = make_blobs(n_samples=100, centers=3, cluster_std=1.0, random_state=42) # 使用Agnes算法进行聚类 agnes = Agnes(n_clusters=3) labels = agnes.fit(X) # 可视化聚类结果 plt.scatter(X[:,0], X[:,1], c=labels) plt.show() ``` 运行以上代码,即可得到聚类结果的可视化图像。

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