(ViennaRNA) [denghua@node envs]$ RNAfold -v Input string (upper or lower case); @ to quit ....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8
时间: 2023-09-24 15:12:58 浏览: 32
根据您提供的信息,这是调用ViennaRNA软件包中的RNAfold命令的命令行操作。该命令会提示您输入RNA序列,您可以按照提示输入RNA序列。输入完成后,RNAfold命令将会计算RNA序列的二级结构以及最小自由能,并将结果输出到终端中。在输入RNA序列时,大写和小写字母都是可以接受的,如果您输入完RNA序列后想退出程序,可以输入“@”字符并按下回车键。希望这可以帮助您使用ViennaRNA软件包中的RNAfold命令进行RNA结构预测。
相关问题
(base) [denghua@node site-packages]$ ./configure --prefix=/storage/denghua/ViennaRNA -bash: ./configure: No such file or directory
这个错误通常是因为你没有正确设置当前目录或者缺少必要的依赖库。请确保你已经正确进入了你的项目目录,并且已经正确安装了项目所依赖的库和工具。你可以使用命令`ls`查看当前目录下的文件和目录,确认是否存在`configure`文件。如果没有,你可以从项目的源代码中获取或者重新下载。如果你已经确认存在`configure`文件,那么请检查是否有执行权限,你可以使用命令`chmod +x configure`来添加执行权限。
/usr/bin/which: no RNAfold in (/storage/denghua/anaconda3/bin:/storage/denghua/anaconda3/condab in:/usr/local/bin:/usr/bin:/usr/local/sbin:/usr/sbin:/storage/denghua/miniconda3/bin:/anaconda3 /envs/Viennarna/bin:/storage/denghua/bin:/storage/denghua/anaconda3/envs/python/bin:/storage/de nghua/miniconda3/bin:/anaconda3/envs/Viennarna/bin) (base) [denghua@node ~]$
这个错误提示说明终端无法找到RNAfold的安装路径。可能是ViennaRNA-2.5.0没有正确安装,或者安装路径没有被添加到系统的环境变量中。
你可以尝试使用`find`命令在系统中查找RNAfold的安装路径。在终端中输入以下命令:
```
sudo find / -name "RNAfold" -type f
```
该命令会在整个系统中查找文件名为`RNAfold`的文件,并输出其路径。如果找到了RNAfold的安装路径,可以将其添加到系统的环境变量中。
另外,你也可以尝试重新安装ViennaRNA-2.5.0,并确保安装路径正确。安装完成后,再次运行`RNAfold -h`命令,如果终端输出RNAfold的帮助信息,则表示ViennaRNA-2.5.0已经成功安装。