R语言代谢途径高级热图代码

以下是使用R语言绘制代谢途径高级热图的示例代码：

library(ggplot2)
library(RColorBrewer)

# 载入数据
data <- read.table("pathway_data.txt", header=TRUE, sep="\t")

# 设置颜色渐变
colors <- colorRampPalette(brewer.pal(9, "YlOrRd"))(256)

# 绘制热图
ggplot(data, aes(x=Sample, y=Pathway, fill=Expression)) +
  geom_tile(color="white") +
  scale_fill_gradientn(colours=colors, na.value="white") +
  labs(title="Metabolic Pathway Analysis",
       x="Sample", y="Pathway") +
  theme(axis.text.x = element_text(angle=90, hjust=1, vjust=0.5),
        plot.title = element_text(hjust=0.5)) 

在这个示例代码中，我们使用 `ggplot2` 和 `RColorBrewer` 库来绘制热图。首先，我们从文件中读入代谢途径的数据，然后设置颜色渐变，并使用 `geom_tile` 函数绘制热图。最后，我们设置热图的标题、x轴和y轴标签，并调整x轴标签的角度和位置，以及标题的位置。

请注意，这里的数据文件需要按照特定的格式来存储，其中第一列是代谢途径的名称，第二列是样本名称，第三列是该代谢途径在该样本中的表达量。