MIMIC-iv中的如何提取微生物指标代码是什么
时间: 2024-04-23 17:22:41 浏览: 10
在MIMIC-IV中提取微生物指标的代码可以使用SQL语言编写,以下是一个示例代码:
```
SELECT subject_id, charttime, spec_itemid, org_itemid, isolate_num, ab_itemid, dilution_text, dilution_comparison, dilution_value, dilution_value_2, interpretation
FROM microbiologyevents
WHERE spec_type_desc = 'BLOOD CULTURE'
AND LOWER(org_name) IN ('staphylococcus aureus', 'escherichia coli', 'klebsiella pneumoniae')
AND charttime BETWEEN '2182-01-01' AND '2182-01-02'
```
这段代码中,我们从"microbiologyevents"数据表中提取了在指定时间范围内(2182-01-01至2182-01-02)进行的血液培养检测结果,并且只选择了"staphylococcus aureus"、"escherichia coli"和"klebsiella pneumoniae"这三种微生物的检测结果。代码中的各个字段含义如下:
- subject_id: 病人ID
- charttime: 检测时间
- spec_itemid: 标本类型ID
- org_itemid: 微生物种类ID
- isolate_num: 微生物计数
- ab_itemid: 抗生素ID
- dilution_text: 稀释方法
- dilution_comparison: 稀释比较符号
- dilution_value: 稀释值
- dilution_value_2: 稀释值2
- interpretation: 结果解释
需要注意的是,以上示例代码只是提取微生物指标的一种方法,具体提取方法需要根据实际需求和数据表结构进行调整。同时,使用MIMIC-IV数据库时需要遵守相关的使用规定和法律法规,保护病人隐私和数据安全。