批量nii,gz文件转化为npy 
时间: 2023-04-06 10:01:01 浏览: 58
可以使用Python中的nibabel库来实现批量nii,gz文件转化为npy文件。具体实现方法可以参考以下代码:
```python
import os
import numpy as np
import nibabel as nib
# 定义输入和输出文件夹路径
input_folder = '/path/to/input/folder'
output_folder = '/path/to/output/folder'
# 遍历输入文件夹中的所有nii,gz文件
for file_name in os.listdir(input_folder):
if file_name.endswith('.nii.gz') or file_name.endswith('.nii'):
# 读取nii,gz文件
img = nib.load(os.path.join(input_folder, file_name))
# 获取nii文件的数据
data = img.get_fdata()
# 将数据保存为npy文件
np.save(os.path.join(output_folder, file_name[:-7] + '.npy'), data)
```
以上代码中,`input_folder`和`output_folder`分别为输入和输出文件夹的路径。遍历输入文件夹中的所有nii,gz文件,读取数据后保存为npy文件。需要注意的是,保存的npy文件名需要与原文件名相同,只是后缀名改为`.npy`。
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